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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003275`

染色体: Chr01 坐标: 51458965-51463055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003275`
名称	SmilChr01G003275
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51458965 - 51463055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991532`
GeneID	`130991532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991532`
原始查询	`LOC130991532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20
Arabidopsis	`AT1G55150` (RH20) DEA(D/H)-box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841958] identity=83.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0197200` (OsRH20) - identity=84.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771787.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057771787.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057771787.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771787.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51459338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B50,B99,C40,D2
`Chr1:51459360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B50,B99,C40,D2
`Chr1:51459528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C13,C23
`Chr1:51460406`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460406`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460440`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460440`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460444`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460444`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B37,C20,C50
`Chr1:51460458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B36
`Chr1:51460686`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr1:51460686`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771787.1

507 aa

254

507

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 126-296 aa PF04851 ResIII 145-290 aa PF00271 Helicase_C 333-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771787.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	126	296	8.6e-51	172.7	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057771787.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	145	290	2.1e-06	28.5	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057771787.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	333	442	1.2e-32	113.1	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915804.1
CTGAAATTTCCAATAGCAAAATCTGAGGGCGGTGAGAGGAATACTCCATCCACACTCTCAACTTTTCTGAGTCTTCTCCTATTGCAATTCCTAAATTTCGCTCCTCAAAACCCTAATTTCAAATTTCCCTAATCTCACAGGAAGACTTCGAGCTGTACGTGCACCATGAGCCGCTACGACAGCCGCTCCGCTGACCCCGGCTCCTACCGTGACCGCCGCGGGGATTCGGGGTTCGGTTATAAGAGAGAATACGAGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991532
ATGAGCCGCTACGACAGCCGCTCCGCTGACCCCGGCTCCTACCGTGACCGCCGCGGGGATTCGGGGTTCGGTTATAAGAGAGAATACGAGAGCAGTTATCGGTCCTCGTCCTCGGCGAAGAAAGACTCCGATGGCGGGGCGGAGGCTGCGCCACGGAAGTCGGAGTTGGATGGTCTGACGCCGTTTGAGAAGAATTTTTACGTGGAGTCTCAGTCAATTGCTGCTATGTCGGAAAGTGACGTGGAAGAGTATAGGCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771787.1
MSRYDSRSADPGSYRDRRGDSGFGYKREYESSYRSSSSAKKDSDGGAEAAPRKSELDGLTPFEKNFYVESQSIAAMSESDVEEYRRRREITVEGKDVPKPVKSFNDVGFPEYVLQEIEKAGFTEPTPIQAQGWPMALKGRDLIGIAETGSGKTLAYLLPAIVHVNAQPFLAPGDGPIVLVLAPTRELAVQIQQEATKFGASSKIKNTCIYGGVPKGPQVRDLQKGVEVVIATPGRLIDMLESHHTNLRRVTYLVLDEADR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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