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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000335`

染色体: Chr07 坐标: 2265269-2270167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000335`
名称	SmilChr07G000335
描述	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2265269 - 2270167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991533`
GeneID	`130991533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991533`
原始查询	`LOC130991533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit
产物	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit
Arabidopsis	`AT5G19180` (ECR1) E1 C-terminal related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832038] identity=73.76; qcov=0.987; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os01g0271500` - identity=71.07; qcov=0.982; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0019781 (NEDD8 activating enzyme activity); GO:0045116 (protein neddylation)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00899 (ThiF); PF08825 (E2_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991533

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771783.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771783.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057771783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2266522`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B138,B47,B75,B78,C45,C65
`Chr7:2266532`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B138,B47,B75,B78,C45,C65,D6
`Chr7:2266930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:2268203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C84
`Chr7:2268230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C85
`Chr7:2269392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B53,C9
`Chr7:2269404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B32,B63,C41,C75
`Chr7:2269476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B105,C77
`Chr7:2269938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771783.1

447 aa

224

447

ThiF

E2_bind

PF00899 ThiF 41-323 aa PF08825 E2_bind 343-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771783.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	41	323	9.9e-58	195.8	ThiF family
`XP_057771783.1`	Pfam	`PF08825`	E2_bind	Domain	343	413	5.6e-18	65.5	E2 binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915800.1
ATATGCAATACCAAGCAATTCCAACATGTTAGCAGTTCTTCGCTTAGCCAAACATAAAGTCGCGTCGGTTGGAAAATAAACAAATCAAAATTAAAGAATAAAAACTCAATTAATTGCACGCAGAGTATAAGATATCACTGCAGAGGATACTGCGGGAACGTATTTGAAGATCCTTTGTTTACAATTTTCTCGAAGAGCAAAGGAAGCTTTTACTGTCTGCAACAATGGCGGTGTCTCAGCCCAGCAGATCAAGAGACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771783.1_34806
ATGGCGGTGTCTCAGCCCAGCAGATCAAGAGACCTCGATAAGCTTCTCCTCCGCCCTGGTCACCTCGTTGGCCCGACCTTTGAGCCTGGCCCAGAACTGAGGGAGGGCATGAAAGAGATAGTGAAGGTGTTGGTGGTGGGAGCTGGTGGGCTGGGCTGCGAAGTGCTAAAGGACTTGGCTTTAACTGGCTTTCGGAACCTTGATGTAATCGATATGGATCGGATTGAGGTCACCAACCTTAATCGCCAGTTCCTCTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771783.1
MAVSQPSRSRDLDKLLLRPGHLVGPTFEPGPELREGMKEIVKVLVVGAGGLGCEVLKDLALTGFRNLDVIDMDRIEVTNLNRQFLFRLEDVGKPKAEVAAKRVMERVNGVNITPHFCRIEDKPDIFYSDFGIIVLGLDSIEARSYINKVACGFLEYDSDDNPRQETVIPMVDGGTEGFKGHARIIIPGTTPCFECTIWLFPPQVKFPLCTLAETPRNAAHCIEYAHLIKWNEVHGRKSFDPDNPEDMQWVYLEAVQRAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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