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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000784`

染色体: Chr07 坐标: 5514603-5517451 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000784`
名称	SmilChr07G000784
描述	THO complex subunit 4A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5514603 - 5517451 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991891`
GeneID	`130991891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991891`
原始查询	`LOC130991891`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	THO complex subunit 4A
产物	THO complex subunit 4A
Arabidopsis	`AT5G59950` (AT5G59950) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836117] identity=60.2; qcov=1.03; evalue=1.04e-75; confidence=high
Rice	`Os03g0278300` - identity=53.9; qcov=1.15; evalue=9.76e-74; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006406 (mRNA export from nucleus)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13865 (FoP_duplication)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772322.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772322.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057772322.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772322.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5515030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C71
`Chr7:5516806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C59,C81
`Chr7:5516814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,C24,C36,C59,C81
`Chr7:5516837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:5517098`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A19,A2,A24,B125,B13,B62,B7,B75,B80,B95,C21,C24,C31,C36,C41,C59,C81,D2
`Chr7:5517118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B44,B74
`Chr7:5517189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:5517219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772322.1

237 aa

118

237

RRM_1

FoP_duplication

PF00076 RRM_1 79-147 aa PF13865 FoP_duplication 180-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772322.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	79	147	1e-15	58.0	RNA recognition motif
`XP_057772322.1`	Pfam	`PF13865`	FoP_duplication	Family	180	231	3.1e-08	34.8	C-terminal duplication domain of Friend of PRMT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916339.1
AAAGGATTCGAAAAGAAAGTTGAAATTCCTCTTGCTTGGTCACTTTCTCTCTCTACATTTGGAATCTCTCTCTCTCTCCACAGCCCACCCTTTTTAGCTCTCCTCAACTCCTCCCGCTTCCGAACCCTAATTTTACCTGCAGCTTCTTCAGATCTTCTTCGCTCCAATCGTTTGTGCGAGCCATAAGCAAGCGAAGATGTCAGGCGCTGCGCTCGACATGACTCTCGACGATCTAATCAAGAACAACAAGAAGTCTGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991891
ATGTCAGGCGCTGCGCTCGACATGACTCTCGACGATCTAATCAAGAACAACAAGAAGTCTGGCGCCGCCCGAGGCAGAGGCCGTGCCGCCGGTCCTGGCCCCGCGCGCCGCCCGACCAACCGTTTCGCGAATCGCGTGACTCCCTATTCCGCTCCCCAGGCTCCGGAGACGGCTTGGGGCCATGACATGTTCCCAGCTGGCGGTCGATCTTCCAGTATAGAGACGGGGACGAAGTTGTATATTTCCAATTTAGACTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772322.1
MSGAALDMTLDDLIKNNKKSGAARGRGRAAGPGPARRPTNRFANRVTPYSAPQAPETAWGHDMFPAGGRSSSIETGTKLYISNLDYGVSNEDIKELFSEVGDLKRYVVHYDRSGRSKGTAEVVFSRRQDAMAAIKRYNNVQLDGKPMKLELVGTNITTPGAGAGGFPSAGAFVDSNVAPRSGQGRGGFGRPRGGRGRGFGRGRGQGSGQGRGRGEKVSAEDLDADLEKYHADAMQTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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