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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000814`

染色体: Chr07 坐标: 5741070-5743083 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000814`
名称	SmilChr07G000814
描述	tropinone reductase homolog At2g29260, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5741070 - 5743083 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991981`
GeneID	`130991981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991981`
原始查询	`LOC130991981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tropinone reductase homolog At2g29260, chloroplastic-like
产物	tropinone reductase homolog At2g29260%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G29260` (AT2G29260) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817475] identity=72.1; qcov=0.977; evalue=8.25e-133; confidence=high
Rice	`Os03g0268900` - identity=58.7; qcov=0.961; evalue=1.75e-108; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00960 (Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057772402.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057772402.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057772403.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772403.1`
5	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057772403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5741318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:5741662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:5741694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B34
`Chr7:5741698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B140,C48,C63
`Chr7:5742026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:5742029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:5742077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C16
`Chr7:5742824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:5742854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:5742856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:5742857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:5742975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772402.1

304 aa

152

304

SDR

adh_short

adh_short_C2

PF23441 SDR 51-294 aa PF08659 KR 54-213 aa PF00106 adh_short 54-243 aa PF13561 adh_short_C2 62-295 aa

XP_057772403.1

257 aa

128

257

adh_short

adh_short_C2

SDR

PF00106 adh_short 11-196 aa PF13561 adh_short_C2 13-248 aa PF23441 SDR 43-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772402.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	51	294	6e-10	39.7	SDR-like rossmann domain
`XP_057772402.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	54	213	4.9e-09	37.1	KR domain
`XP_057772402.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	54	243	1.9e-49	168.5	short chain dehydrogenase
`XP_057772402.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	62	295	4.7e-60	203.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057772403.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	11	196	3.8e-42	144.7	short chain dehydrogenase
`XP_057772403.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	13	248	1.2e-57	195.9	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057772403.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	43	247	4.9e-08	33.4	SDR-like rossmann domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916419.1
ATTCAATAAAGTTTAGGGGGCAAAATGAAAATTGCCACTGTTTGAATATATCGCCGCCACCGGAATTCACAAGGCCTTTTTAGCACGGAATACATAGGAAACATGCCGCCGGCCATTTACTCCGGCGCCGCCGCTTCCCTCAAGCTTTATTCTACGAAATCCATGCCGTCAGCTGACTCCTCACATGTAAACTGCCGCTTGTCGCGCTTCACGACAGCCGCCTCCGCCGCGAAACCCTCCCGCTGGTCTCTTCATGGCTC...

XM_057916420.1
CATTTACTCCGGCGCCGCCGCTTCCCTCAAGCTTTATTCTACGAAATCCATGCCGTCAGCTGACTCCTCACATGTAAACTGCCGCTTGTCGCGCTTCACGACAGCCGCCTCCGCCGCGAAACCCTCCCGCTGGTCTCTTCATGGCTCCACCGCCCTCGTTACTGGTGGCACCAGGGGAATCGGGTATGGCTAGGCATGCAATTGTGGAGGAATTGGCTTCTCTTGGTGCCACAGTGCACACGTGTGCAAGGAACGAAGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991981
ATGCCGCCGGCCATTTACTCCGGCGCCGCCGCTTCCCTCAAGCTTTATTCTACGAAATCCATGCCGTCAGCTGACTCCTCACATGTAAACTGCCGCTTGTCGCGCTTCACGACAGCCGCCTCCGCCGCGAAACCCTCCCGCTGGTCTCTTCATGGCTCCACCGCCCTCGTTACTGGTGGCACCAGGGGAATCGGGCATGCAATTGTGGAGGAATTGGCTTCTCTTGGTGCCACAGTGCACACGTGTGCAAGGAACGAAGA...

LOC130991981
ATGGCTCCACCGCCCTCGTTACTGGTGGCACCAGGGGAATCGGGTATGGCTAGGCATGCAATTGTGGAGGAATTGGCTTCTCTTGGTGCCACAGTGCACACGTGTGCAAGGAACGAAGATGAGCTGGAGAGAAGTTTGAGGGATTGGGAAGAGCAGGGTCTTGGAGTTACGGGCTCGGTGTGCAATGTATCTTCTGAACCTGACCGGGAAAGGTTACTCGACAATGTTAACTCTGTATTCAATGGGAAGCTCAACATTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772402.1
MPPAIYSGAAASLKLYSTKSMPSADSSHVNCRLSRFTTAASAAKPSRWSLHGSTALVTGGTRGIGHAIVEELASLGATVHTCARNEDELERSLRDWEEQGLGVTGSVCNVSSEPDRERLLDNVNSVFNGKLNILINNVGTNIRKPMVDFTSEEFSLVMGTNFGSAFHMCQLAYPLLKASGAGTVVFTSSVSGFVSLKNMSVHGASKGAINQLTKNLACEWARDSIRVNAVAPWYIRTSMVEQVLGNKEYLEEVYHRTPMR...

XP_057772403.1
MAPPPSLLVAPGESGMARHAIVEELASLGATVHTCARNEDELERSLRDWEEQGLGVTGSVCNVSSEPDRERLLDNVNSVFNGKLNILINNVGTNIRKPMVDFTSEEFSLVMGTNFGSAFHMCQLAYPLLKASGAGTVVFTSSVSGFVSLKNMSVHGASKGAINQLTKNLACEWARDSIRVNAVAPWYIRTSMVEQVLGNKEYLEEVYHRTPMRRLGDPTEVSSAVAFLCLPASSFITGQIICVDGGMSVNGFYPKYM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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