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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000845`

染色体: Chr07 坐标: 6018944-6025920 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000845`
名称	SmilChr07G000845
描述	alpha-glucan phosphorylase, H isozyme
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6018944 - 6025920 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992017`
GeneID	`130992017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992017`
原始查询	`LOC130992017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-glucan phosphorylase, H isozyme
产物	alpha-glucan phosphorylase%2C H isozyme
Arabidopsis	`AT3G46970` (PHS2) alpha-glucan phosphorylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823850] identity=81.7; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0851700` (Pho2) - identity=81.2; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005980 (glycogen catabolic process); GO:0008184 (glycogen phosphorylase activity); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00343 (Phosphorylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772456.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772456.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772456.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772456.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772456.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6020365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:6020402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,B125,C33,D2
`Chr7:6020893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,C5,C60,D10
`Chr7:6021338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C26,D7
`Chr7:6022887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:6022923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,C8
`Chr7:6022990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C84
`Chr7:6023261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B17,C7
`Chr7:6023279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B125,C33
`Chr7:6023539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B74,C29,C55
`Chr7:6024344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B9,C86
`Chr7:6024370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772456.1

846 aa

423

846

Phosphorylase

PF00343 Phosphorylase 120-840 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772456.1`	Pfam	`PF00343`	Phosphorylase	Family	120	840	1.3e-300	999.6	Carbohydrate phosphorylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916473.1
TTTCTCGAAATTCTTTTAAACGAACGGCAATTAATAATTTAGGAAATGTACAAGCTCACTAAGCTTAAGGTACTACAATTAACGAGCCCCAATGCTCCATATCGAAACGCGATATTTCATCGGAGTTGGTGTCTTCTTCACATGTGTCTCTTCCTCTCCCCCTCTGATATTTATTACCTTCACAATCGCACTCTCGATCAATCGTTCATGACCACAAAACCAGAGCTGCCATTACACACACTTTTTCCTTTTCGCTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992017
ATGGCAGATACAGCAAAGGCGAACGGTAGTACCACTGATAGGGCTAAAATTTTGGAGAAGATTCCACCGGTAGCGAATCCGCAGGCCAAAGTGCCAGCTGAAATTGCGTCTAATATCAACTATCATGCTCACTACAGCCCTCACTTTTCCCCCCTTAAGTTCGAGCCGGAGCAAGCATTCTATGCTACAGCGGAAAGCGTTCGTGATCAGCTGATCAAGCAATGGAATGACACATATAGTCACTATCACAAAGTCAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772456.1
MADTAKANGSTTDRAKILEKIPPVANPQAKVPAEIASNINYHAHYSPHFSPLKFEPEQAFYATAESVRDQLIKQWNDTYSHYHKVNPKQTYYLSMEYLQGRALTNAVGNLDVQDAYANALKQLGYALEEITEQEKDAALGNGGLGRLASCFLDSMATLSLPAWGYGLRYRYGLFKQLMTKSGQEEIAEDWLEKFSPWEIPRHDVVFPIRFFGQVEVNPNGSRKWIGGEVIQAVAYDVPIPGYKTKNTNSLRLWEAKARAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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