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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000852`

染色体: Chr07 坐标: 6071625-6075667 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000852`
名称	SmilChr07G000852
描述	non-specific phospholipase C1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6071625 - 6075667 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992025`
GeneID	`130992025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992025`
原始查询	`LOC130992025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific phospholipase C1
产物	non-specific phospholipase C1
Arabidopsis	`AT1G07230` (NPC1) non-specific phospholipase C1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837234] identity=74.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0826600` (NPC1) - identity=76.7; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009395 (phospholipid catabolic process); GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04185 (Phosphoesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057772466.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772466.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772466.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772466.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6072743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D9
`Chr7:6072793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B133,D11
`Chr7:6072871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:6072933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:6072937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:6072998`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B57,C12,C43,C83
`Chr7:6072998`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B57,C12,C43,C83
`Chr7:6073000`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C12,C43,C83
`Chr7:6073000`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C12,C43,C83
`Chr7:6073003`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B60,C12,C43,C83
`Chr7:6073003`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B60,C12,C43,C83
`Chr7:6073004`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B60,C12,C43,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772466.1

538 aa

269

538

Phosphoesterase

PF04185 Phosphoesterase 41-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772466.1`	Pfam	`PF04185`	Phosphoesterase	Family	41	401	4.7e-106	355.7	Phosphoesterase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916483.1
TTTTTCGTTGAATGCAACAACTATAGTATAACTCTAACTTACGCCTTCTCGTATGAACCGATGCATGAGTTAAAATATACTTCTATGCTTCACTAGAATAAGTTTGTTTTTTTATTTTGGGAGATTAATAAGGTGGACCACACAATTTTTCTCCTCAAAAGTAAGTTTCTTAATTTAAGTGTTCAAAAGAATTGAATATATTCTAACGGGACGGAGGAAGTATTTTATAATTTTAAAAAAATTAGATATACATTAATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992025
ATGGGGTTTCTCCGGTTACTCCACCTCCGCGCCGCCGCCGTCTTCCTCACCTACCTCCTCCTCTCCGCCTCCGTCCCTCTCTCATCCCCCAAAAAAACCAAGCACAAAATCAACGGCCCCATCAAAACCTTCGTAGTAGTGGTGATGGAAAACCGCTCCTTCGACCACATGCTCGGCTGGCTCAGGAGAACCCGGCCCGACATCGACGGGCTCACCGGCTCCGAATCTAACCGGGTCAACGCATCCGACCCGAGCTCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772466.1
MGFLRLLHLRAAAVFLTYLLLSASVPLSSPKKTKHKINGPIKTFVVVVMENRSFDHMLGWLRRTRPDIDGLTGSESNRVNASDPSSPSVAVTDGAVFVESDPGHSIQAIREQIFGRNDTSAKPAPMDGFVQQAESMGVAGMAATVMSGFKPELVPVYTELANQFAVMDRWFASVPASTQPNRFYVHSATSHGASSNVRKDLIRGFPQKTIFDSLDENDLDFGIYYQNIPATLFFKSLRKLKNIVKFHSYALKFKLDALLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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