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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000951`

染色体: Chr07 坐标: 6821396-6822302 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000951`
名称	SmilChr07G000951
描述	uncharacterized SmilChr07G000951
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6821396 - 6822302 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992189`
GeneID	`130992189`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992189`
原始查询	`LOC130992189`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	growth-regulating factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820609]; symbol=GRF5; hit=AT3G13960; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	growth-regulating factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820609]; symbol=GRF5; hit=AT3G13960; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G13960` (GRF5) growth-regulating factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820609] identity=55.3; qcov=0.271; evalue=7e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0776900` (GRF1) - identity=51.3; qcov=0.279; evalue=2e-07; confidence=weak
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0032502 (developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF08880 (QLQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992189

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772721.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772721.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772721.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772721.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6821654`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A2,A22,A3,A5,A7,A8,B108,B110,B112,B114,B120,B131,B132,B139,B16,B18,B23,B3,B34,B36,B44,B47,B54,B55,B56,B81,B85,B96,C23,C24,C28,C31,C33,C35,C5,C58,C61,C70,C72,C74,C76,C79,C81,C83,C87,C9,D5,D9
`Chr7:6821658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A11,C42,C71
`Chr7:6821678`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B15,B47,B50,B86,C10,C22,C77
`Chr7:6821695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B27,B74,C14,C65
`Chr7:6821737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:6821811`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B107,B122,B137,C39
`Chr7:6821811`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B107,B122,B137,C39
`Chr7:6821816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B27,B74,C14,C65
`Chr7:6821939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A13,B10,B38,B39,B78,B89,C35,C4,C71,D8
`Chr7:6821968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:6821984`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	68	A10,A20,A21,A24,B10,B100,B102,B105,B109,B11,B111,B113,B117,B118,B124,B128,B129,B134,B135,B139,B14,B17,B22,B25,B29,B3,B32,B33,B53,B6,B62,B7,B75,B78,B8,B82,B87,B90,B92,B95,C11,C14,C15,C16,C20,C21,C25,C27,C30,C32,C37,C39,C4,C52,C53,C55,C62,C67,C68,C69,C7,C73,C75,C76,C81,C84,D1,D6
`Chr7:6821992`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A23,B103,B111,B127,B30,B5,B72,B74,B82,C41,C57,C60,C86,C87,C9,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772721.1

140 aa

140

QLQ

PF08880 QLQ 80-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772721.1`	Pfam	`PF08880`	QLQ	Domain	80	113	7.2e-11	42.3	QLQ

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916738.1
TACAACCGGTCGCATAGCCTGCGACGGGTTCGCCCGGCCCAACCCAGTTACTTAAAATATAAAAGCTTTTTTTTCATTTTTTTCTCACTTTCTTCCTTCCCCCGCCCCCTATTCGATTAGGGTTTCTTTTCTCTTTTCTCTCTCTTCCGATTCCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTTTCGTTTTTCTTTCTATTAATTAAAGGAATGGATAGTGGCTACAGCAGTGGGTTTAACAGGAAAACATCGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992189
ATGGATAGTGGCTACAGCAGTGGGTTTAACAGGAAAACATCGTTAAACAGTGATTTTCTTCGTTGGACAAAGAGCACTTCTACTGGATCCAAGATTTCTCATCATCATCAACAAACTAATCCCCACCGTCTATTTAGTATTGGAGATGATGATGATGATGCGGGGCCCACCAATGAGATGGCGTTCGGAGGTGGCACCACTCCCCCTGCAGCTGGAGGAGTGGCGTCGACGGGTTTTCCATTCACAGGTGCGCAATGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772721.1
MDSGYSSGFNRKTSLNSDFLRWTKSTSTGSKISHHHQQTNPHRLFSIGDDDDDAGPTNEMAFGGGTTPPAAGGVASTGFPFTGAQWKELERQAMIYKCMISCVPVLPHLLFPLDSAFSCKYCKYSIYFHSPIPPSISAHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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