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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001052`

染色体: Chr07 坐标: 7682791-7687717 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001052`
名称	SmilChr07G001052
描述	aromatic aminotransferase ISS1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7682791 - 7687717 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992222`
GeneID	`130992222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992222`
原始查询	`LOC130992222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aromatic aminotransferase ISS1
产物	aromatic aminotransferase ISS1
Arabidopsis	`AT1G80360` (AT1G80360) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844376] identity=66.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0178000` (P0509B06.2-1) - identity=71.2; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772755.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772755.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057772755.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772755.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7682955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:7683025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:7683250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:7684758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:7685327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr7:7685884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772755.1

394 aa

197

394

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 31-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772755.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	31	380	2.1e-54	185.8	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916772.1
GCAACGGTTTGTGTGAGAAGGAAATAGTAGAAAACTGGAATACGTATATATTATGTATACTTTTGGCTTTTACCACCTTTTCTATCCAATCTTTTCTCTGTGATCACATAAAATAACATGTATTTTCAGAAAATATTATTGAAAAAAATGAACTTTCCAACTTTTCGAAAAAATAGTAAACAATTTAAATCTTGTAAGGGTAGGTGAGAAAACGCCAAGATAGCAAAACCTTCATACGGTGAAATAAATCTTTTTTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992222
ATGGGTTCTTATGGGATGCTTGCAAAGAGGGCTTTGCTTACTGAAACTCCTGTTATGGTTGAGATGCAGAAGCTGATCCGAGGTGTGAAAGATTGCGTTTCTCTAGCTCAGGGGGTAGTATACTGGCTACCACCGAAGGAGGCACTCGAAAAAGTGCAACAACTAGTATGGGAGCCTTCAGTTAGTCGCTATGGTGCTGATGAGGGCCTTCCTGAGCTGAGAGAGGCCTTAACAAATAAGTTACACAATGAAAACAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772755.1
MGSYGMLAKRALLTETPVMVEMQKLIRGVKDCVSLAQGVVYWLPPKEALEKVQQLVWEPSVSRYGADEGLPELREALTNKLHNENKLKKSSVMVTAGANQAFVNIVLTLCDAEDSVVMFAPYYFNSYMSFQMTGVTNILVGPGDPNTLHPDADWLENTLQHTKPTPKLVTVVNPGNPSGTYIPAPLLQRISDICKKAGCWLVVDNTYEYFMYDGRKHVCLEDDHIVNIFSFSKAYGMMGWRVGYIAYPSEVEGLAAQLLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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