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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001169`

染色体: Chr07 坐标: 8799130-8802732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001169`
名称	SmilChr07G001169
描述	cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8799130 - 8802732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992344`
GeneID	`130992344`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992344`
原始查询	`LOC130992344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial-like
产物	cytochrome c1-2%2C heme protein%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G40810` (AT5G40810) Cytochrome C1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834081] identity=83.6; qcov=0.903; evalue=9.94e-166; confidence=high
Rice	`Os01g0935700` (P0492G09.27-1) - identity=85.8; qcov=0.862; evalue=5.6e-173; confidence=high
GO	GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c); GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02167 (Cytochrom_C1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992344

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772929.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057772929.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057772929.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772929.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8800787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D11
`Chr7:8800952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:8802063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr7:8802063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772929.1

346 aa

173

346

Cytochrom_C1

PF02167 Cytochrom_C1 89-293 aa

XP_057772930.1

318 aa

159

318

Cytochrom_C1

PF02167 Cytochrom_C1 89-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772929.1`	Pfam	`PF02167`	Cytochrom_C1	Family	89	293	8e-96	320.6	Cytochrome C1 family
`XP_057772930.1`	Pfam	`PF02167`	Cytochrom_C1	Family	89	305	2.3e-100	335.5	Cytochrome C1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916946.1
TTTACGTCATTGATTTTGAACCTTTTATTTGCTCGGCTCTCTTCTACACACGCACGCCCTCTCACTCTCTCTCTAGACACTCACAAACCCAAACACCAAATTAACAGTAATTTCTGTCCTGTGCTAACAGACTAGTTGCAGTCCATCCTAGAATGAGAATGGAAAAAGTGAACAGATTTATCGCGCGATTAGCTGGTCCAAGGGTTGTTAATGAGCGTTCTCTTGCAGTTTCTGATATGAAGGTTGTTCCTTCTCTTCTT...

XM_057916947.1
TTACGTCATTGATTTTGAACCTTTTATTTGCTCGGCTCTCTTCTACACACGCACGCCCTCTCACTCTCTCTCTAGACACTCACAAACCCAAACACCAAATTAACAGTAATTTCTGTCCTGTGCTAACAGACTAGTTGCAGTCCATCCTAGAATGAGAATGGAAAAAGTGAACAGATTTATCGCGCGATTAGCTGGTCCAAGGGTTGTTAATGAGCGTTCTCTTGCAGTTTCTGATATGAAGGTTGTTCCTTCTCTTCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992344
ATGAGAATGGAAAAAGTGAACAGATTTATCGCGCGATTAGCTGGTCCAAGGGTTGTTAATGAGCGTTCTCTTGCAGTTTCTGATATGAAGGTTGTTCCTTCTCTTCTTTTGAAGCATGGTCAAGGTGGAAATGATTCTGCTGGCCCAAAGTTCTTCAATATGTTTGCGCTTTTAGGTGCAGGAACTACTGGATTTTTTAGTTTTGCAACAGTTTCATATGCTTCTGATGAGGCTGAGCATGGGCTGGAGTCTCCTAGCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772929.1
MRMEKVNRFIARLAGPRVVNERSLAVSDMKVVPSLLLKHGQGGNDSAGPKFFNMFALLGAGTTGFFSFATVSYASDEAEHGLESPSYPWPHKGILSSYDHASIRRGHQVYQQVCASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEETKAMAAEIEVADGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPYPNEQAARFANGGAYPPDLSLITKARHNGQNYVFALLTGYHDPPAGVMIREGLHYNPYFPGGAIAMPKMLNDGAVEYEDGTPATEAQMG...

XP_057772930.1
MRMEKVNRFIARLAGPRVVNERSLAVSDMKVVPSLLLKHGQGGNDSAGPKFFNMFALLGAGTTGFFSFATVSYASDEAEHGLESPSYPWPHKGILSSYDHASIRRGHQVYQQVCASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEETKAMAAEIEVADGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPYPNEQAARFANGGAYPPDLSLITKARHNGQNYVFALLTGYHDPPAGVMIREGLHYNPYFPGGAIAMPKMLNDGAVEYEDGTPATEAQMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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