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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001470`

染色体: Chr07 坐标: 11542292-11544971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001470`
名称	SmilChr07G001470
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11542292 - 11544971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992603`
GeneID	`130992603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992603`
原始查询	`LOC130992603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=29.6; qcov=0.581; evalue=1.75e-19; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=26; qcov=0.678; evalue=2.54e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773289.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773289.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773289.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773289.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11542540`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B57,B63,C12,D5
`Chr7:11542540`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B57,B63,C12,D5
`Chr7:11542546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C12,D5
`Chr7:11542557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C12,D5
`Chr7:11542619`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A1,A10,A13,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A7,B105,B107,B113,B114,B115,B117,B119,B122,B125,B126,B127,B129,B130,B136,B16,B20,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B36,B48,B53,B55,B57,B59,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B74,B78,B83,B84,B86,B92,B93,B99,C12,C14,C15,C21,C23,C34,C35,C4,C41,C43,C45,C46,C50,C56,C57,C58,C6,C62,C67,C69,C72,C74,C75,C8,C82,C86,D10,D2,D3,D5
`Chr7:11542625`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	98	A1,A10,A13,A14,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A7,B103,B105,B107,B113,B114,B115,B117,B119,B122,B125,B126,B127,B129,B130,B133,B135,B136,B140,B16,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B36,B46,B48,B53,B55,B57,B59,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B74,B78,B83,B84,B86,B92,B93,B99,C12,C14,C15,C21,C23,C34,C35,C4,C41,C43,C45,C46,C50,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C67,C69,C72,C73,C74,C75,C8,C82,C86,C87,D10,D2,D3,D5,D9
`Chr7:11542634`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	105	A1,A10,A13,A14,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A7,B103,B105,B107,B113,B114,B115,B117,B119,B122,B125,B126,B127,B129,B130,B133,B135,B136,B16,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B36,B39,B44,B46,B48,B53,B55,B57,B59,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B74,B78,B83,B84,B86,B92,B93,B99,C12,C14,C15,C16,C2,C21,C23,C34,C35,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C48,C50,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C8,C82,C86,C87,D10,D2,D3,D5,D9
`Chr7:11542655`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	115	A1,A10,A13,A14,A16,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A7,B1,B101,B103,B105,B107,B113,B114,B115,B117,B119,B122,B125,B126,B127,B129,B130,B133,B135,B136,B140,B15,B16,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B36,B39,B43,B44,B46,B48,B53,B54,B55,B57,B59,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B71,B74,B78,B8,B83,B84,B86,B89,B90,B92,B93,B99,C12,C14,C15,C21,C23,C34,C35,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C48,C50,C52,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C8,C82,C86,C87,D10,D2,D3,D5,D9
`Chr7:11542659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A14,A3,B103,B133,B136,B44,B54,B57,C14,C15,C45,C57,C60,C87
`Chr7:11542837`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B53,B62
`Chr7:11542837`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B53,B62
`Chr7:11542838`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	173	A1,A10,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B121,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B31,B33,B36,B38,B39,B43,B44,B48,B50,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B71,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C21,C23,C26,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773289.1

482 aa

241

482

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 13-52 aa PF24758 LRR_At5g56370 109-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773289.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	52	9.2e-05	22.9	F-box domain
`XP_057773289.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	109	229	5.2e-11	43.3	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917306.1
GAAAAGTTCGTTTTTTGCGGACTTTTTCCTACCTTAGATGGATACGGATCCAACCAAACAGTGTGAAGCTCTCTAATTTTACTCCCCAAACATTCTTTTTTTTTTCTTTGAGAGCTCCAAACATTCTCTCTGTGTGTTTGTTCATTAGCTCAAACGAGGGTTTTTTATTGGGGCTGCAGCAATCGAGAGAACGAAGCACATTCATTTTGAGGTAACCTTCGAGAATTTGATTTGCGTTAGATAATTTTGAGTTGTGGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992603
ATGAAAAAATCAAAGAGAAGTAAAGCTGAGGATCGACTCAGCGAGTTGCCGGACTCAGTAATATTTCAGATATTGTGGTTGTTGCCGATGACAGATGTGGTTAGGACAATAATTCTATCCAAGCGCTGGAGAAACCTTTGGACCACCACCCCGTTCCTTAATTTCGACAATGAAGCTATGTCGATTAATGATAATGATAATGATGATAGACTTCTGAAATTCGTTAATCGGGCTTTATTATGCTGGAACGGAATCAGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773289.1
MKKSKRSKAEDRLSELPDSVIFQILWLLPMTDVVRTIILSKRWRNLWTTTPFLNFDNEAMSINDNDNDDRLLKFVNRALLCWNGIRVLKFKFVSRQQLYDSTYSDINLWVSFAMRNRVEDLYLNVYCESVSGMDGGKNDVYWVPQFLFSCPSLKELTLIDCNIDISGDVQWNQLKSLRIEGFRVTAHVIDQILIGTPQLTVFILRFADVGESLSIQSSSLKELSIDKYFLTYEDLWTFSELRIWTPNLETLEIKGIPYSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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