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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002059`

染色体: Chr07 坐标: 18740932-18744180 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002059`
名称	SmilChr07G002059
描述	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18740932 - 18744180 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993141`
GeneID	`130993141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993141`
原始查询	`LOC130993141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4, mitochondrial-like
产物	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G13430` (AT5G13430) Ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831184] identity=77.7; qcov=1.01; evalue=1.29e-150; confidence=high
Rice	`Os04g0398500` - identity=74.9; qcov=1.04; evalue=1.04e-138; confidence=high
GO	GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c); GO:0008121 (quinol-cytochrome-c reductase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00355 (Rieske); PF02921 (UCR_TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057773903.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057773903.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057773903.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773903.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18741336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C30,D9
`Chr7:18741356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C35,C40,C81
`Chr7:18743283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr7:18743338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:18743446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B104,B94,C45
`Chr7:18743614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B27,C6,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773903.1

269 aa

134

269

UCR_TM

Rieske

PF02921 UCR_TM 101-140 aa PF00355 Rieske 198-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773903.1`	Pfam	`PF02921`	UCR_TM	Family	101	140	8.1e-10	39.6	Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region
`XP_057773903.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	198	253	1e-09	38.9	Rieske [2Fe-2S] domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917920.1
GAAAAGAAAAATTGTGGAGTGAGGAACAGAGGGAGTAAGTAATAAACAAAACAGCGCATCAATGTGAACTAAACTAAATAGCAGAAAATGGGCTAGTAAAATTCGAAGCCCGATCACATCTTTCAGATCCGGCCCAGCCTCGAACACCGTGGGCCGTGAAATCGTCAAAGTTTAAGATACGGCGTCGTGCCATTCACCATATCGAACTTTTATTTTTCCTTTTCTATTTGCATTCTCCATTTTCCCTTCTTCTTCCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993141
ATGCTGAGGGTAGCGGGGAGGAGGTTGTCCTCTCTCTCATGGCGGTCGGGTCAGGCTCCATCCGCCGCATTCGCCTCCAGAAACCCGTTTGTCGGCGGCGATTCATTATCGGATGGACGCACTTCTTCACCCGTTCAATCAATTTCTGTTTTTGATCAGATCAGAGGGTTCTCTTCTGGTGCCCTTGCAGCAGGGCAGGACTCAGGCTTGGTTCCGGAAGCCCCTGCTACAGTTGCAGCAATCAAGAATCCCAGCTCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773903.1
MLRVAGRRLSSLSWRSGQAPSAAFASRNPFVGGDSLSDGRTSSPVQSISVFDQIRGFSSGALAAGQDSGLVPEAPATVAAIKNPSSKIVYDEHNHERYPPGDPSKRAFAYFVLTGGRFVYASLARLLVLKFVLSMSASKDVLALASLEVDLSSIEPGTTVTVKWRGKPVFIRRRTEDDIKLANSVDVASLRDPQEDAVRVKNPEWLVVVGVCTHLGCIPLPNAGDYGGWFCPCHGSHYDISGRIRKGPAPFNLEVPTYTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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