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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002097`

染色体: Chr07 坐标: 19084069-19086597 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002097`
名称	SmilChr07G002097
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19084069 - 19086597 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993174`
GeneID	`130993174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993174`
原始查询	`LOC130993174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300
Arabidopsis	`AT1G34300` (AT1G34300) lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840330] identity=35.3; qcov=1; evalue=1.8e-121; confidence=medium
Rice	`Os10g0101000` - identity=49.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773933.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773933.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773933.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773933.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19084247`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr7:19084247`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr7:19084324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:19084844`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:19084844`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:19085341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C27
`Chr7:19086068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:19086100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:19086109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:19086307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A7,B63,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773933.1

779 aa

390

779

S_locus_glycop

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF00954 S_locus_glycop 220-288 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 482-759 aa PF00069 Pkinase 484-757 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773933.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	220	288	8.1e-07	30.3	S-locus glycoprotein domain
`XP_057773933.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	482	759	1.2e-43	150.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057773933.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	484	757	4.7e-47	161.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917950.1
TATGGAAGTCAACGCTGACTGTCTTCCTCCATTCCACACGGCACATGAAAGCCGCCATTAAAATCCTTCAAACCCACCTTCAAACAACCCCATTCCACCACAATGTCTTCTCTCACCCATCTTCTCCCTTTCTTCTTCTTCTGCTTGACGCTCTCAATCCTCAATGTATCTCACTCTCAAGCACAGCCCACTAACATCTCCGTCTTCTCTTCCTCCAACTCCCTATGGCTGCCCGGCCAGAACCAGACTCTCCTCTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993174
ATGTCTTCTCTCACCCATCTTCTCCCTTTCTTCTTCTTCTGCTTGACGCTCTCAATCCTCAATGTATCTCACTCTCAAGCACAGCCCACTAACATCTCCGTCTTCTCTTCCTCCAACTCCCTATGGCTGCCCGGCCAGAACCAGACTCTCCTCTCCCCCGACGCCGCCTTCGCCGCCGGGTTCCTCCCCGTCCCCAACTCCCCCGGCCTCTACACCTTCTCCGTCTGGTTCCGCAACGTCGTCTCCCTCAACGCCGTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773933.1
MSSLTHLLPFFFFCLTLSILNVSHSQAQPTNISVFSSSNSLWLPGQNQTLLSPDAAFAAGFLPVPNSPGLYTFSVWFRNVVSLNAVVWNATRSPVSAAASLLISRSGELRLVSSSANSTNLWPAIVNGSGLSLLSNGNLVYGSFQSFNFPTNTILPNQQINGTTLFSSNGKYKFDSRQLVFIGRNDNYWTNLGNFTFMSLDDLGVIAYGNNAMYYASDFGVKKLRKLSLDDDGNLRLYSYDVGLSQWIVRWQALFQLCMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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