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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002337`

染色体: Chr07 坐标: 21699422-21705274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002337`
名称	SmilChr07G002337
描述	lon protease homolog, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21699422 - 21705274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993414`
GeneID	`130993414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993414`
原始查询	`LOC130993414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lon protease homolog, mitochondrial-like
产物	lon protease homolog%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G28000` (AT4G28000) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828913] identity=67.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0584600` - identity=62; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF17862 (AAA_lid_3); PF24933 (DUF7751)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057774275.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057774275.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057774275.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057774275.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21699693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:21700414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B13,B131,B82,C2
`Chr7:21700627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:21700990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:21701055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B26,C2
`Chr7:21703338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:21703640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C48
`Chr7:21703868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:21703944`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr7:21703944`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr7:21704856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B93,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774275.1

805 aa

402

805

DUF7751

AAA

AAA_lid_3

PF24933 DUF7751 349-409 aa PF00004 AAA 530-660 aa PF17862 AAA_lid_3 683-724 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774275.1`	Pfam	`PF24933`	DUF7751	Domain	349	409	5.5e-34	117.1	Domain of unknown function (DUF7751)
`XP_057774275.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	530	660	2.3e-41	142.0	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057774275.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	683	724	1.4e-13	50.8	AAA+ lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918292.1
CCAGTTCAGCTCCTCATCCTCTCAATTTAACAAAGGAATTGATTTGACCAACGCCTCATTCGCACCAAAAAACTCCGTTATTCTGCACATCTTTGCTACACCACCTATACGTATATCCTCCTATATACGTATAGGCGCGGATTTTGTATGTGTTGGTTGGTGGTGACGATGATTGTGTGATGGAACAGAAGCACGTATTGTTGTCGGCATTGGGCGTTGGGGTAGGAGTCGGCCTCGGCTTGGCCTCCGGTTCCACGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993414
ATGGAACAGAAGCACGTATTGTTGTCGGCATTGGGCGTTGGGGTAGGAGTCGGCCTCGGCTTGGCCTCCGGTTCCACGCTTAGCCGATGGACCGCCGCCGCCGCCGAAGATGGCATCTCCGCCGAGGGGATACAGCTGGAGCTTCTTAGATTGGTTGTCGATGGAAAGAGCTGCGGAGTTACCTTTGACGAGTTTCCATATTATCTCAGTGAGCGAACGCGTCTCTTGTTAACAAATGCAGCATATGTTCATCTGAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774275.1
MEQKHVLLSALGVGVGVGLGLASGSTLSRWTAAAAEDGISAEGIQLELLRLVVDGKSCGVTFDEFPYYLSERTRLLLTNAAYVHLKHLDVSKHTRNLSPASRAILLSGPAEPYQQTLVKALAHHFDAKLLLLDMANFSLKIQSKFGSTKKETSLQRSISEVTFERVSSFLGSFSALPSREDDREVKSSLQHRRASSVSSDMSSISFQSYSSSAAPSKRMNWSFDEKVFMRSLYKVLVSVSEISSIVLYIRDVDKLFLQSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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