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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002410`

染色体: Chr07 坐标: 22448332-22451793 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G002410`
名称	SmilChr07G002410
描述	pre-mRNA cleavage factor Im 25 kDa subunit 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22448332 - 22451793 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993491`
GeneID	`130993491`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130993491`
原始查询	`LOC130993491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA cleavage factor Im 25 kDa subunit 2
产物	pre-mRNA cleavage factor Im 25 kDa subunit 2
拟南芥	`AT4G25550` (AT4G25550) Cleavage/polyadenylation specificity factor, 25kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828660] identity=88.38; qcov=0.99; evalue=3.43e-135; confidence=high
水稻	`Os04g0683100` - identity=93.12; qcov=0.945; evalue=3.16e-135; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005849 (mRNA cleavage factor complex); GO:0006378 (GO:0006378)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13869 (NUDIX_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993491

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`XP_057774379.1`
2	核质	0.80000	`XP_057774379.1`
3	细胞质	0.80000	`XP_057774379.1`
4	核仁	0.40000	`XP_057774380.1`
5	核仁纤维中心	0.20000	`XP_057774379.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22448648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B44,C16,C70
`Chr7:22448651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:22449005`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A3,B50,B88,B89,C1,C44,C50,C6
`Chr7:22449037`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	40	A1,A10,A14,A15,A22,A5,A8,B11,B115,B118,B134,B139,B3,B36,B4,B41,B47,B57,B65,B66,B68,B72,B8,B80,B88,C20,C24,C26,C42,C49,C52,C59,C62,C67,C71,C73,C75,C85,C9,D6
`Chr7:22449185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:22449368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774379.1

217 aa

108

217

NUDIX_2

PF13869 NUDIX_2 6-179 aa

XP_057774380.1

200 aa

100

200

NUDIX_2

PF13869 NUDIX_2 6-193 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057774379.1`	Pfam	`PF13869`	NUDIX_2	Domain	6	179	1e-77	260.6	Nucleotide hydrolase
`XP_057774380.1`	Pfam	`PF13869`	NUDIX_2	Domain	6	193	5.2e-86	287.6	Nucleotide hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918397.1
AGCAAAGTCGCATTTATTTATACAGAGGAAGAGTTGCGACATCATTTCGAGTATTTGCAGAGCGGGGAAGCGACACGCCCTCAATTTTTCCACATTCCCGCTGCAAATTCTGCGCAAAGTAGAAGAAATCCATTGCCGCAAATCTGCAATAATTTACGGCAAGAGACAAAGTAATAATTAATCAGAGAAAGAGGGGGAAATGGTGACTTCGCCGGTGGTAAATACGTATCCTCTTTCGAGCTACACTTTCGGCACCAAAG...

XM_057918396.1
AGTCGCATTTATTTATACAGAGGAAGAGTTGCGACATCATTTCGAGTATTTGCAGAGCGGGGAAGCGACACGCCCTCAATTTTTCCACATTCCCGCTGCAAATTCTGCGCAAAGTAGAAGAAATCCATTGCCGCAAATCTGCAATAATTTACGGCAAGAGACAAAGTAATAATTAATCAGAGAAAGAGGGGGAAATGGTGACTTCGCCGGTGGTAAATACGTATCCTCTTTCGAGCTACACTTTCGGCACCAAAGAGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057774380.1_37562
ATGGTGACTTCGCCGGTGGTAAATACGTATCCTCTTTCGAGCTACACTTTCGGCACCAAAGAGCCGAAGATGGAGAAAGACACCTCCGTCGCCGATCGCCTTGCCCGCATGAAAGTCAACTACATGAAGGAAGGCATGAGGACTAGTGTCGAGGGTATTTTGCTGGTCCAAGAGCATAATCATCCCCATATCCTTCTTTTGCAAATTGGAAATACATTTTGTAAACTTCCAGGTGGTAGATTGAAGCCAGGAGAGAATGA...

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057774379.1_37563
ATGGTGACTTCGCCGGTGGTAAATACGTATCCTCTTTCGAGCTACACTTTCGGCACCAAAGAGCCGAAGATGGAGAAAGACACCTCCGTCGCCGATCGCCTTGCCCGCATGAAAGTCAACTACATGAAGGAAGGCATGAGGACTAGTGTCGAGGGTATTTTGCTGGTCCAAGAGCATAATCATCCCCATATCCTTCTTTTGCAAATTGGAAATACATTTTGTAAACTTCCAGGTGGTAGATTGAAGCCAGGAGAGAATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774379.1
MVTSPVVNTYPLSSYTFGTKEPKMEKDTSVADRLARMKVNYMKEGMRTSVEGILLVQEHNHPHILLLQIGNTFCKLPGGRLKPGENEIEGLKRKLSSKLAANSPSLQPDWQVGECVAIWWRPNFETIMYPYCPPHITKPKECKKLFLVHLSEREYFAVPKNLKLLAVPLFELYDNVQVCERFSTFSRRFTATPPGPTHTHTHTHTYIYIYRDRDVAS

XP_057774380.1
MVTSPVVNTYPLSSYTFGTKEPKMEKDTSVADRLARMKVNYMKEGMRTSVEGILLVQEHNHPHILLLQIGNTFCKLPGGRLKPGENEIEGLKRKLSSKLAANSPSLQPDWQVGECVAIWWRPNFETIMYPYCPPHITKPKECKKLFLVHLSEREYFAVPKNLKLLAVPLFELYDNVQRYGPVISTIPQQLSRFQFNMIHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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