当前解析结果
SmilChr07G002630| 统一基因 ID | SmilChr07G002630 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002630 |
| 描述 | zinc finger protein 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 25373199 - 25374320 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993697 |
|---|---|
| GeneID | 130993697 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130993697 |
| 原始查询 | LOC130993697 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger protein 5 |
| 产物 | zinc finger protein 5 |
| 拟南芥 | AT5G06650 (GIS2)C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830553] identity=37.78; qcov=0.344; evalue=4.4e-14; confidence=low |
| 水稻 | Os01g0512700- identity=60.78; qcov=0.187; evalue=7.71e-13; confidence=weak |
| GO | GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0010026 (trichome differentiation); GO:0010090 (trichome morphogenesis) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993697 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774706.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:25373709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B34,B45 |
Chr7:25373816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B34,B45,B88 |
Chr7:25373831 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C9 |
Chr7:25374054 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 63 | A15,A2,A24,A25,B1,B100,B104,B105,B114,B115,B119,B120,B122,B123,B125,B131,B136,B138,B31,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B46,B51,B56,B6,B63,B79,B81,B89,B91,B95,B96,B99,C10,C2,C22,C27,C28,C32,C35,C40,C43,C49,C57,C59,C6,C62,C68,C7,C72,C73,C77,C8,C81,C82,C86,D3,D4,D6 |
Chr7:25374058 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B137 |
Chr7:25374058 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr7:25374109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。