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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002640`

染色体: Chr07 坐标: 25549961-25551513 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002640`
名称	SmilChr07G002640
描述	metalloendoproteinase 2-MMP-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25549961 - 25551513 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993705`
GeneID	`130993705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993705`
原始查询	`LOC130993705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metalloendoproteinase 2-MMP-like
产物	metalloendoproteinase 2-MMP-like
Arabidopsis	`AT1G70170` (MMP) matrix metalloproteinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843353] identity=55.5; qcov=0.965; evalue=1.55e-134; confidence=high
Rice	`Os02g0740700` (OsMMP1) - identity=52; qcov=0.905; evalue=4e-108; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030198 (extracellular matrix organization); GO:0030574 (collagen catabolic process); GO:0031012 (extracellular matrix)
KEGG	-
Pfam	PF00413 (Peptidase_M10); PF01471 (PG_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057774712.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774712.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057774712.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057774712.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25550470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B37,B58,C78
`Chr7:25550476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:25550526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:25550593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:25550654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:25550780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:25550821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C50
`Chr7:25551241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B88,C50
`Chr7:25551278`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B10,B107,B129,B133,B16,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774712.1

368 aa

184

368

PG_binding_1

Peptidase_M10

PF01471 PG_binding_1 64-118 aa PF00413 Peptidase_M10 167-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774712.1`	Pfam	`PF01471`	PG_binding_1	Domain	64	118	6e-09	36.7	Putative peptidoglycan binding domain
`XP_057774712.1`	Pfam	`PF00413`	Peptidase_M10	Domain	167	323	9.7e-51	172.5	Matrixin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918729.1
AAAGGTTAACAAAATTCGCAAAAGAAAACTATGTAGAGAACGTGTGGAAGAACTTGCTCGGAAAGAAGAATGCTTCAAATTTTCAATATTTCTAAATCAGTCCATATTTTAATACGACTCAGACTTCAGTTATGAAACCCACACACACATCTTCTCTCTCTCTCTCTAACGTATAAAACTGTCTTCGATTTTTAGTAGAATGCTGTAAAATTGATTGTAGGTTTACCGAAAAAAATGAAATTCCCAATTGGCACAGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993705
ATGAAATTCCCAATTGGCACAGTGGCCGTAATTTTCCTGTTTTCCCTAATTTCTGTGGATCCAAATCCAGTTTCCGCTCATTTCTTCCCAAATATATCATCAATTCCATCTTCCATAATCCCAAACGCTTCAATCTGGGACGCTTTCAGCGGCCTGCACGGCTGCCGGAAAGGCGTGAAATCTAAAGGCCTAGCCAACCTCAAGAAGTATTTCCAGCTCTTCGGCTACCTCAACACCTCTTACAATGATTTCTCCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774712.1
MKFPIGTVAVIFLFSLISVDPNPVSAHFFPNISSIPSSIIPNASIWDAFSGLHGCRKGVKSKGLANLKKYFQLFGYLNTSYNDFSDDFDDFLESAVRNYQLNFNLNGTGELDAPTLKHIVLPRCGNPDIVNGTSTMRSGKSHSANSSTIHTVAHYSFFPNRPRWPPGKSELTYAFAPENQLPDAVKGVFARAFERWSEVTPLTFTEAASFNRADLKIGFFSGDHGDGEPFDGVLGTLAHAFSPPVGRLHFDGAESWVTDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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