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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003870`

染色体: Chr07 坐标: 48170472-48172453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G003870`
名称	SmilChr07G003870
描述	oxysterol-binding protein-related protein 2A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48170472 - 48172453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994579`
GeneID	`130994579`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130994579`
原始查询	`LOC130994579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxysterol-binding protein-related protein 2A
产物	oxysterol-binding protein-related protein 2A
拟南芥	`AT4G22540` (ORP2A) OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828349] identity=65.67; qcov=0.995; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os08g0154900` - identity=59.83; qcov=0.908; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0015248 (GO:0015248); GO:0016020 (membrane); GO:0032934 (sterol binding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00169 (PH); PF01237 (Oxysterol_BP); PF15413 (PH_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994579

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质基质	0.80000	`XP_057775605.1`
2	细胞质	0.60000	`XP_057775605.1`
3	高尔基体	0.40000	`XP_057775605.1`
4	囊泡	0.20000	`XP_057775606.1`
5	内体	0.20000	`XP_057775606.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48171490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr7:48172132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B67,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775605.1

752 aa

376

752

PH_11

Oxysterol_BP

PF00169 PH 59-168 aa PF15413 PH_11 60-167 aa PF01237 Oxysterol_BP 374-727 aa

XP_057775606.1

684 aa

342

684

PH_11

Oxysterol_BP

PF00169 PH 59-168 aa PF15413 PH_11 60-167 aa PF01237 Oxysterol_BP 374-655 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057775605.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	59	168	2.6e-11	44.7	PH domain
`XP_057775605.1`	Pfam	`PF15413`	PH_11	Domain	60	167	9.4e-09	36.4	Pleckstrin homology domain
`XP_057775605.1`	Pfam	`PF01237`	Oxysterol_BP	Family	374	727	2.4e-131	438.7	Oxysterol-binding protein
`XP_057775606.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	59	168	8.8e-11	43.0	PH domain
`XP_057775606.1`	Pfam	`PF15413`	PH_11	Domain	60	167	9.3e-09	36.4	Pleckstrin homology domain
`XP_057775606.1`	Pfam	`PF01237`	Oxysterol_BP	Family	374	655	1.2e-101	341.0	Oxysterol-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091801.1
GGATGATAGCATGTATTTTGTAAATGGTGAAGGAACTGACAATGCAAAAGATAGGTCTGAGTCTGAGGCATCTTTATTGTGGAAAAGAAATAAGCCTCCCTCGAACCTTACCCGCTATAACCTAACTTCTTTCGCTATTACACTGAACGAATTGACACCAGGACTGAAGCTCTATCTGATTCCAAGTATTTGATGACGGATGAAGGAGAAGCTCCCTCCTACAGATTCGAGACTGAGACCAGACCAACGGCATCTGGAAA...

XM_057919622.1
GGATGATAGCATGTATTTTGTAAATGGTGAAGGAACTGACAATGCAAAAGATAGGTCTGAGTCTGAGGCATCTTTATTGTGGAAAAGAAATAAGCCTCCCTCGAACCTTACCCGCTATAACCTAACTTCTTTCGCTATTACACTGAACGAATTGACACCAGGACTGAAGGAGAAGCTCCCTCCTACAGATTCGAGACTGAGACCAGACCAACGGCATCTGGAAAATGGGGAATTTGACAAGGCAAATGTGGAAAAGCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057775605.1_39109
GATGATAGCATGTATTTTGTAAATGGTGAAGGAACTGACAATGCAAAAGATAGGTCTGAGTCTGAGGCATCTTTATTGTGGAAAAGAAATAAGCCTCCCTCGAACCTTACCCGCTATAACCTAACTTCTTTCGCTATTACACTGAACGAATTGACACCAGGACTGAAGGAGAAGCTCCCTCCTACAGATTCGAGACTGAGACCAGACCAACGGCATCTGGAAAATGGGGAATTTGACAAGGCAAATGTGGAAAAGCTTCG...

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057775606.1_39110
GATGATAGCATGTATTTTGTAAATGGTGAAGGAACTGACAATGCAAAAGATAGGTCTGAGTCTGAGGCATCTTTATTGTGGAAAAGAAATAAGCCTCCCTCGAACCTTACCCGCTATAACCTAACTTCTTTCGCTATTACACTGAACGAATTGACACCAGGACTGAAGTATTTGATGACGGATGAAGGAGAAGCTCCCTCCTACAGATTCGAGACTGAGACCAGACCAACGGCATCTGGAAAATGGGGAATTTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775605.1
MRVKEMHPLCCITLESPGIGEGSPEPGLLRSDSAVNFTGGGSEGNAGGSDVGTSTSVAGILYKWTNYGKGWRSRWFTLTDNGVLSYSKSRRPGSQTGSDVVLIGSAAGSSRGGRKHGKTVGIVHLKISSFRESKSDDRRFYIFTATKTLHLRTNSKKERVAWIQALNSTRSLFSLRPQSESTPLLTRELSVSTERLKQRLLEEGVGEGVVKDCEQIVLSEFSGVQGQFQLLCEERSNLLDTLRQLEAANIEAEASGINDG...

XP_057775606.1
MRVKEMHPLCCITLESPGIGEGSPEPGLLRSDSAVNFTGGGSEGNAGGSDVGTSTSVAGILYKWTNYGKGWRSRWFTLTDNGVLSYSKSRRPGSQTGSDVVLIGSAAGSSRGGRKHGKTVGIVHLKISSFRESKSDDRRFYIFTATKTLHLRTNSKKERVAWIQALNSTRSLFSLRPQSESTPLLTRELSVSTERLKQRLLEEGVGEGVVKDCEQIVLSEFSGVQGQFQLLCEERSNLLDTLRQLEAANIEAEASGINDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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