当前解析结果
SmilChr07G004050| 统一基因 ID | SmilChr07G004050 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004050 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004050 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 51810645 - 51815960 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994731 |
|---|---|
| GeneID | 130994731 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130994731 |
| 原始查询 | LOC130994731 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Myosin heavy chain-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842636]; symbol=AT1G63300; hit=AT1G63300; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Myosin heavy chain-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842636]; symbol=AT1G63300; hit=AT1G63300; species=arabidopsis; confidence=high |
| 拟南芥 | AT1G63300 (AT1G63300)Myosin heavy chain-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842636] identity=45.04; qcov=0.993; evalue=0.0; confidence=high |
| 水稻 | Os03g0107400- identity=24.82; qcov=0.83; evalue=5.27e-29; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10358 (NT-C2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994731 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057775780.1 |
| 2 | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775780.1 |
| 3 | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775780.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:51810871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:51810954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr7:51811616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr7:51812139 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr7:51812285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B104,B36,C35 |
Chr7:51812297 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,A21,B21,B40,C10 |
Chr7:51812369 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,A21,B20,B40 |
Chr7:51812392 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr7:51812562 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr7:51812582 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B26,B58,B66 |
Chr7:51812659 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B99,C50,C55,C73 |
Chr7:51812666 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 33 | A15,A21,B104,B113,B12,B127,B131,B134,B16,B22,B25,B26,B27,B32,B34,B36,B43,B58,B62,B66,B99,C32,C37,C45,C48,C50,C54,C55,C60,C7,C73,C75,D1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775780.1PF10358
NT-C2 11-140 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775780.1 |
Pfam | PF10358 |
NT-C2 | Domain | 11 | 140 | 1.9e-21 | 76.9 | N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。