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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004650`

染色体: Chr07 坐标: 59318681-59320836 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G004650`
名称	SmilChr07G004650
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59318681 - 59320836 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995195`
GeneID	`130995195`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130995195`
原始查询	`LOC130995195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
拟南芥	`AT3G50150` (AT3G50150) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824177] identity=33.41; qcov=0.835; evalue=2.39e-71; confidence=low
水稻	`Os05g0242000` - identity=33.02; qcov=0.85; evalue=1.35e-65; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995195

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞膜	1.00000	`XP_057776332.1`
2	细胞质基质	0.20000	`XP_057776332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59318849`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,A8,B109,B126,B14,B140,B2,B20,B25,B35,B38,B39,B66,B67,B72,C13,C17,C31,C37,C39,C57
`Chr7:59318854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B52,C54,C76
`Chr7:59318872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B83
`Chr7:59318872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr7:59318898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr7:59318921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B52,C43,C86
`Chr7:59318935`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A21,A25,B104,B111,B113,B115,B12,B121,B122,B123,B125,B137,B16,B52,B60,B61,B62,B81,B87,B95,C18,C38,C43,C44,C47,C5,C50,C54,C6,C65,C67,C78,C8,C83,C86,D3
`Chr7:59318937`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A21,A25,B111,B113,B115,B12,B121,B122,B123,B125,B137,B16,B22,B52,B60,B61,B62,B81,B87,B95,C18,C38,C43,C44,C47,C5,C50,C54,C65,C67,C78,C8,C83,C86,D3
`Chr7:59318951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C5,C6
`Chr7:59318984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:59319023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B34,C24,C5
`Chr7:59319025`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A25,B104,B111,B12,B123,B137,B3,B52,B60,B81,B87,C18,C43,C47,C5,C54,C76,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776332.1

468 aa

234

468

DUF247

PF03140 DUF247 74-454 aa

XP_057776333.1

422 aa

211

422

DUF247

PF03140 DUF247 28-408 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057776332.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	74	454	4.4e-120	402.4	Plant protein of unknown function
`XP_057776333.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	28	408	3.1e-120	402.9	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920349.1
GAGCAGAATTTTGGAAAAAGTAAAACAACCTAACAAAGAACCGATTGTTTTGATAAAAAGTAGCCCGGTCTGGTCAATTGATAAAGCGGGCGGATGGCTTGCAAGGTGTTCAAATCTTAAGGGTGAAGCGTTCAAAGAAAAAGAAAATCTGTGTTTCATTATGGAATCAGCACTTTCCCAAACAGCACGTAAGTTATAATTTCCAAGAGAACTGAAGGCGATGGGTAGAAATTCAGAATAACCAACTAACTTCTGAGGAG...

XM_057920350.1
TTTTGGAAAAAGTAAAACAACCTAACAAAGAACCGATTGTTTTGATAAAAAGTAGCCCGGTCTGGTCAATTGATAAAGCGGGCGGATGGCTTGCAAGGTGTTCAAATCTTAAGGGTGAAGCGTTCAAAGAAAAAGAAAATCTGTGTTTCATTATGGAATCAGCACTTTCCCAAACAGCACGTAAGTTATAATTTCCAAGAGAACTGAAGGCGATGGGTAGAAATTCAGAATAACCAACTAACTTCTGAGGAGAAATCTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057776332.1_40001
ATGATATTGAGTGTATATTCCCCTGAAGATATATTACTTGCTCTCGAAACCAACCAGCAGCTGCTAACTGCTAAGTACTACTTCATCCACTGCCAATCATGCTCAAAAATTTCTCAACGTTATATCATATATATGGATCCTAACAGCACAACGGAAGCCTGCGCTAGCTTGAATGAAAAACTGACGAAACTCAACGCGGGGGCAGAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTGAATCCCAA...

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057776333.1_40002
ATGCTCAACACAACGGAAGCCTGCGCTAGCTTGAATGAAAAACTGACGAAACTCAACGCGGGGGCAGAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTGAATCCCAATGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATTGGTCCTTATCACTGCAACAAGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATCACAAGCTACGTTACTTCCAGCACCTCATCAGAAGGAAACCTTCCAACAGTGTGGAAAGATACGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776332.1
MILSVYSPEDILLALETNQQLLTAKYYFIHCQSCSKISQRYIIYMDPNSTTEACASLNEKLTKLNAGAESECTIYRVHKHLRNVNPNAYEPEVIAIGPYHCNKDHLKMMEDHKLRYFQHLIRRKPSNSVERYAACVGRLEAEARKCYADEPTSLSPSDFIQMLVLDGCFIVELLLKRDMVSLREKNDPIIQMDWMIISVQRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIHEAPGQHSMLRDLLLRFFDDLYPGKNYRGEASVAPREV...

XP_057776333.1
MLNTTEACASLNEKLTKLNAGAESECTIYRVHKHLRNVNPNAYEPEVIAIGPYHCNKDHLKMMEDHKLRYFQHLIRRKPSNSVERYAACVGRLEAEARKCYADEPTSLSPSDFIQMLVLDGCFIVELLLKRDMVSLREKNDPIIQMDWMIISVQRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIHEAPGQHSMLRDLLLRFFDDLYPGKNYRGEASVAPREVKHLLHLIHRNWLPRGTGTKKKDKRLQFINSAARLKEANVRFEISEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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