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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001903`

染色体: Chr07 坐标: 16438494-16441039 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001903`
名称	SmilChr07G001903
描述	4-coumarate--CoA ligase-like 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16438494 - 16441039 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995590`
GeneID	`130995590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995590`
原始查询	`LOC130995590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-coumarate--CoA ligase-like 9
产物	4-coumarate--CoA ligase-like 9
Arabidopsis	`AT5G63380` (AT5G63380) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836457] identity=49.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0901600` (OsACS6) - identity=45.2; qcov=1.04; evalue=3e-150; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776931.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776931.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057776931.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057776931.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057776931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16438763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:16438824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:16438834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:16438983`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A10,A14,A22,B100,B102,B11,B12,B124,B127,B129,B131,B15,B16,B19,B20,B26,B52,B55,B57,B58,B59,B62,B63,B76,B79,C13,C14,C61,C71,C72,C73,C74
`Chr7:16438995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:16439025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B8,C27,C86
`Chr7:16439032`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A10,A14,A18,A22,A23,A7,B10,B102,B11,B113,B114,B124,B125,B127,B129,B131,B16,B19,B20,B22,B35,B36,B38,B47,B52,B55,B57,B62,B65,B73,B76,B78,B79,B8,B94,C1,C13,C14,C43,C47,C59,C64,C65,C69,C71,C72,C73,C75,C76,C78,C79,C87,D10
`Chr7:16439057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B12,B42,B55,C71
`Chr7:16439064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:16439102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C34
`Chr7:16439107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B26,B64
`Chr7:16439118`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A13,A18,A2,A22,A23,A7,B10,B107,B113,B114,B115,B126,B127,B131,B16,B20,B35,B36,B38,B47,B53,B55,B57,B58,B65,B66,B73,B76,B78,B94,C1,C13,C18,C28,C47,C59,C6,C64,C65,C69,C73,C75,C76,C78,C79,C87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776931.1

544 aa

272

544

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 59-400 aa PF13193 AMP-binding_C 452-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776931.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	59	400	6.7e-72	243.1	AMP-binding enzyme
`XP_057776931.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	452	527	4.1e-17	63.6	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920948.1
GGTTTTTTGAAAGAGAATTTTGGTGCTTGGATAGGCCTCGTAGTGATTTGGCAATTGGAGTGTTATGTTACTCATCATTCTGAATGGCCAAATTTAAGTTACTACAAAACATTGCATTTACTTACGTAAGTCTTCCACCACCACACACGGCGGCGGAACAATGGAGCCATCTTCAAGCTCCATAGTTGATCCAAACAGCGGCTTCTCTCCCCAAACCAAAATCTTCCACAGCCTCCGCCCCTCCGTTTCCTTCCCCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995590
ATGGAGCCATCTTCAAGCTCCATAGTTGATCCAAACAGCGGCTTCTCTCCCCAAACCAAAATCTTCCACAGCCTCCGCCCCTCCGTTTCCTTCCCCTCTTCCTCTCTCCCACACTACGTCTTCTCCCTCCTCCGCTCCTCCCCTACCTCCGCCTCTCTCATCGACGCCACCACCCGCCGCCGCATCCCCCTCTCTCACCTCCCCCATCTCGTCCAATCCCTAGCCTCCAATCTCCGCCGCAAATTCCACCTCCACAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776931.1
MEPSSSSIVDPNSGFSPQTKIFHSLRPSVSFPSSSLPHYVFSLLRSSPTSASLIDATTRRRIPLSHLPHLVQSLASNLRRKFHLHKNDVAFILSPNSIHIPLLYLSLLSLGAIVSPSNPLSSDSDISHQIHLTRPAIAFVTSATAARLPPLPQGTVVLDSPEFESLLLPCGAEFDPPEVFQDDMAAILYSSGTTGRVKGVELTHRNLIAAIAGVHAVRAVRTSPPVTLCVVPFFHVYGFMVCLREVALGGSLVVAAAEPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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