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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001984`

染色体: Chr07 坐标: 17473544-17478990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001984`
名称	SmilChr07G001984
描述	sphingosine-1-phosphate lyase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17473544 - 17478990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995651`
GeneID	`130995651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995651`
原始查询	`LOC130995651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphingosine-1-phosphate lyase
产物	sphingosine-1-phosphate lyase
Arabidopsis	`AT1G27980` (DPL1) dihydrosphingosine phosphate lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839691] identity=76.7; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0100900` (SPL) - identity=73.8; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008117 (sphinganine-1-phosphate aldolase activity); GO:0019752 (carboxylic acid metabolic process); GO:0030149 (sphingolipid catabolic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5); PF00282 (Pyridoxal_deC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057777001.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057777001.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777001.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777001.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17473979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B37
`Chr7:17474120`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A15,A16,B1,B107,B109,B127,B130,B137,B30,B31,B34,B35,B38,B39,B41,B42,B45,B79,B84,B91,C37,C49,C53
`Chr7:17475400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17475473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B103,C44,C87
`Chr7:17475768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:17475818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17476141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr7:17477047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17477069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr7:17478369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B26,B97,C83
`Chr7:17478404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B131,B34,B87,C3
`Chr7:17478666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777001.1

541 aa

270

541

Pyridoxal_deC

Aminotran_5

PF00282 Pyridoxal_deC 153-446 aa PF00266 Aminotran_5 200-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777001.1`	Pfam	`PF00282`	Pyridoxal_deC	Domain	153	446	2.1e-22	80.1	Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain
`XP_057777001.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	200	464	4.6e-10	39.7	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921018.1
ATACGAATTGAGTCAAAACTTTTACTGCCGTAAATTCATTTATTTTTTTAACTTCAAACCAAGCTACGCAGACTTGTCTGAATAGATGATCAGTCTATTATCAAGTGATCCTATCCTACAAAGCTTTCAACTCTCAGCTGTTTAGCCTGGTAGAAAATATTCCTCCTACGCCACCAATTACTTCATGAGTATATAAACCGAATTTCGAACTCCTTACTCATCAATCCAATACAGATTCAGAAACTGAAGAAACCTAACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995651
ATGGAGTTTCGCCACATATCTTCGTCTCTCAATCGATTCAGAGCTTCGTCTAATTCCTACTTGTCTGAATTCGAGCCTCTCGCGCTACTTCTCATACCTTTGTTGACGTTTTTCATCGCCAGATTAGTTCAATCGGTTCTTGCCGTGGTTTCCGAGAAAGGCCTCAAATCTGCGGCCGTGGAGTTGGTCATGGCCTCTGTCAAGTTGGTGCCTGGTGTGCAGAGGTATATCGATGCTGAAAAGCAGAAGGTTGTGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777001.1
MEFRHISSSLNRFRASSNSYLSEFEPLALLLIPLLTFFIARLVQSVLAVVSEKGLKSAAVELVMASVKLVPGVQRYIDAEKQKVVDKLQGSGKSKRDGWRTELPRVGLGGEVVDQMKDEKLKDVAWQGKCSGTVYIAGSEQEGHFSLINEACSMFAHTNPLHQDVFQSVVKFETEVVAMTAALLGSKEKASGGQICGNMTSGGTESILLAVKTSRDYMKTKKGITNPEMIIPVSAHSAYDKAAQYFKIKLWRVPVDQDFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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