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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002775`

染色体: Chr07 坐标: 27618695-27622917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002775`
名称	SmilChr07G002775
描述	probable apyrase 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27618695 - 27622917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995795`
GeneID	`130995795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995795`
原始查询	`LOC130995795`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable apyrase 6
产物	probable apyrase 6
Arabidopsis	`AT2G02970` (AT2G02970) GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814826] identity=53; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0436100` - identity=55.1; qcov=0.774; evalue=3.43e-161; confidence=high
GO	GO:0009134 (nucleoside diphosphate catabolic process); GO:0016020 (membrane); GO:0017110 (nucleoside diphosphate phosphatase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01150 (GDA1_CD39)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057777203.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057777203.1`
3	Golgi stack	高尔基堆	0.40000	`XP_057777203.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777203.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27619328`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr7:27619328`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr7:27619329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:27621202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:27621219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:27622594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B14
`Chr7:27622594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777203.1

544 aa

272

544

GDA1_CD39

PF01150 GDA1_CD39 72-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777203.1`	Pfam	`PF01150`	GDA1_CD39	Family	72	475	7.7e-83	279.2	GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921220.1
TTAAGATAAAAGGGGATTTCCTTCCCAATATTCAACTGTCAGAAACAGGAAAAACAGTTGCAGAAATAAACACGGAGGGGAGGGAGAGGGCTGCAAAATTCCATTGAAGGGCCCTCTCAAAACTCAACCTTTTTTCCAACAAAAAACAACGAAATTTCGTTTGTGAATCATAGGAATTTTGTTGCTGTTGATCAATTAACACATTCCTATGGTTCACAAAGTTCAATTATTTGATGCGCCGATTGAATGCCCGCACAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995795
ATGCGCCGATTGAATGCCCGCACAGTAAACCCTAGTCCGGAAGAAGAGAAAAAAGATATGGATCCGATCAAACTCCAATTCCGGGCGGGCCGACCTGGATTTCGACCCCCCAATAACAAGCAGCCAAACCCCATATCAAAATGCTGTTTGTACACCACCATCTCAATTGCGATTCTGCTATTTTGCTACATTCTGTTGTTTGGGAACAGAATTAACGAAAACAAGAAATACGGCGTCGTGATCGACGGCGGGAGCACAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777203.1
MRRLNARTVNPSPEEEKKDMDPIKLQFRAGRPGFRPPNNKQPNPISKCCLYTTISIAILLFCYILLFGNRINENKKYGVVIDGGSTGTRIHVFKYDVRNGNLALDFSEKGRASMRVNPGLSAYAEDPQGAGAAVAQLVEFAKRNVPSERWGETEIRLMATAGLRLLEKEDQEKILNACRRTLGASGFRFRDDWASVISGSDEGLYAWVVANYALGTLGAEPTQTTGIIELGGASAQVTFVSNEPMPHEFSRQVKFGNFTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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