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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003419`

染色体: Chr08 坐标: 36381947-36396592 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003419`
名称	SmilChr08G003419
描述	1,4-alpha-glucan-branching enzyme 2-2, chloroplastic/amyloplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36381947 - 36396592 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996551`
GeneID	`130996551`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130996551`
原始查询	`LOC130996551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1,4-alpha-glucan-branching enzyme 2-2, chloroplastic/amyloplastic-like
产物	1%2C4-alpha-glucan-branching enzyme 2-2%2C chloroplastic/amyloplastic-like
拟南芥	`AT2G36390` (SBE2.1) starch branching enzyme 2.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818212] identity=73.53; qcov=0.969; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os02g0528200` (SBE3) - identity=78.74; qcov=0.816; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0003844 (1,4-alpha-glucan branching enzyme activity); GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005978 (glycogen biosynthetic process); GO:0005982 (starch metabolic process); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00128 (Alpha-amylase); PF02806 (Alpha-amylase_C); PF02922 (CBM_48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996551

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亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	叶绿体	1.00000	`SmilChr08G003419.1`
2	叶绿体基质	1.00000	`SmilChr08G003419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36383560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:36389008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,A9,B46,C66
`Chr8:36390239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr8:36392324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:36393269`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A2,A21,A5,A7,B10,B104,B125,B130,B139,B14,B42,B43,B47,B51,B57,B58,B65,B73,B75,B89,C12,C13,C15,C5,C56,C59,C65,C71,C76,C83,D6,D7
`Chr8:36393272`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A2,A21,A5,A7,B10,B104,B125,B130,B139,B14,B42,B43,B47,B51,B57,B58,B65,B73,B75,B89,C12,C13,C15,C5,C56,C59,C65,C71,C76,C83,D6,D7
`Chr8:36393275`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B98,C40,C55
`Chr8:36393275`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B98,C40,C55
`Chr8:36393276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B118,B126,B131,B22,B34,B61,D10
`Chr8:36394144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:36395164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B121,B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G003419.1

来源蛋白: XP_057777809.1

874 aa

437

874

CBM_48

Alpha-amylase

Alpha-amylase_C

PF02922 CBM_48 221-304 aa PF00128 Alpha-amylase 370-441 aa PF02806 Alpha-amylase_C 759-853 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G003419.1` XP_057777809.1	Pfam	`PF02922`	CBM_48	Domain	221	304	7.5e-18	65.4	Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain)
`SmilChr08G003419.1` XP_057777809.1	Pfam	`PF00128`	Alpha-amylase	Domain	370	441	6.6e-13	49.3	Alpha amylase, catalytic domain
`SmilChr08G003419.1` XP_057777809.1	Pfam	`PF02806`	Alpha-amylase_C	Domain	759	853	4.2e-22	79.0	Alpha amylase, C-terminal all-beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092662.1
AATTCACAACCACCAACTGATGCGATTGCCAAATATCCTGATTCACACATCAGCATAGCAGGCCCATGTGACCGAAAGGCCCACGATCCATCCCCTCTCCAACAGATAATTATCACCCGAATTGCCGATGCAGCACCTTTTTGTGTAGGCCCCACTCCATCCAATCTCCCCATGCAGTCATCCTCACACGTACCTCTTCTTCTTTGGTTTGCCCAACACACTCATTATTAATACTTGCTTGCTTCTGGCTCCACAGTTTT...

XM_057921826.1
AATTCACAACCACCAACTGATGCGATTGCCAAATATCCTGATTCACACATCAGCATAGCAGGCCCATGTGACCGAAAGGCCCACGATCCATCCCCTCTCCAACAGATAATTATCACCCGAATTGCCGATGCAGCACCTTTTTGTGTAGGCCCCACTCCATCCAATCTCCCCATGCAGTCATCCTCACACGTACCTCTTCTTCTTTGGTTTGCCCAACACACTCATTATTAATACTTGCTTGCTTCTGGCTCCACAGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G003419.1 (XP_057777809.1)
ATGGTTTACACGCTCTCCGGCGTGCGGCTGCCTGGAGTGCCATCGGCGTACAAGCTTGGGACCAATGGCTGGAACTCGCGCGCCGCCGATAGGACTTCTCGCGTCTCGCTGTTTGTGAAGAATAAAACCAGTTCTCGGAAGATTTTTGCAGGGAAGTCATACGAGTCTGGCTCCCAGTCATCTATGGCGACTACATCAGAGAAGGTTCTCGTTCCAGGCACTGAGAATGATGACCCCTCGTCTCCAAGCGCGGAATTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G003419.1 (XP_057777809.1)
MVYTLSGVRLPGVPSAYKLGTNGWNSRAADRTSRVSLFVKNKTSSRKIFAGKSYESGSQSSMATTSEKVLVPGTENDDPSSPSAELVETVSDNPQISGDTESSETTNRLKVEDQETIIELSSSEVITGEDPSSAQQPDKDVEVKVEGTSDSTYETTNDESMRIRGKIIPPPGNGKRIYEIDPMLSSHRQHLDYRYDQYRKLRAAIDKNEGGLELFSRGYEKFGFVRSEAGITYREWAPGAKSAALIGDFNNWNPNADVMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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