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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003610`

染色体: Chr08 坐标: 39250228-39251599 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003610`
名称	SmilChr08G003610
描述	secoisolariciresinol dehydrogenase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39250228 - 39251599 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996713`
GeneID	`130996713`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130996713`
原始查询	`LOC130996713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	secoisolariciresinol dehydrogenase-like
产物	secoisolariciresinol dehydrogenase-like
拟南芥	`AT1G52340` (ABA2) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841665] identity=53.9; qcov=0.942; evalue=3.22e-90; confidence=high
水稻	`Os04g0179200` (OsMAS) - identity=60.3; qcov=0.967; evalue=2.41e-106; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996713

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	线粒体	1.00000	`SmilChr08G003610.1`
2	过氧化物酶体	1.00000	`SmilChr08G003610.1`
3	线粒体基质	0.20000	`SmilChr08G003610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39250708`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B15,B26,C16,C8
`Chr8:39250708`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B15,B26,C16,C8
`Chr8:39250817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C63,C69
`Chr8:39250847`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A15,B30,C16,C39,C53,C67,C9
`Chr8:39250914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B19,B26,D4
`Chr8:39250920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:39250932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:39251012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:39251022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B46
`Chr8:39251049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39251059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:39251073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G003610.1

来源蛋白: XP_057778004.1

275 aa

138

275

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 17-206 aa PF08659 KR 19-170 aa PF13561 adh_short_C2 25-260 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G003610.1` XP_057778004.1	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	17	206	1.7e-54	185.0	short chain dehydrogenase
`SmilChr08G003610.1` XP_057778004.1	Pfam	`PF08659`	KR	Family	19	170	7.5e-10	39.7	KR domain
`SmilChr08G003610.1` XP_057778004.1	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	25	260	1.4e-67	228.4	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922021.1
ATATTCATCAATACATGAAACTGTGAATAAGATTAAAATTTCACCTGTCTTCATGGTCAACTTATTTAATTAATAGTTTTATCTAAAAACAACTTATTTAATTAATAGTAAGTTAGTATAGTAACAGCCTTTAAATTGTTTCAACTTATCCAAAGCTCCACGCAGCATCATGGCAACCTTCTCAACTCTCTCTGCGCTCACTAGAAGGCTAGAAGGAAAAGTAGCGCTGGTGACCGGAGGAGCGACCGGAATCGGAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G003610.1 (XP_057778004.1)
ATGGCAACCTTCTCAACTCTCTCTGCGCTCACTAGAAGGCTAGAAGGAAAAGTAGCGCTGGTGACCGGAGGAGCGACCGGAATCGGAGAATGCACGGCGAAACTCTTCTCGAAACACGGCGCGAAAGTCGTGATCACCGACGTCCAAGACGAATTAGGGCAATCCGTCGTCAAGCAAATCGGCGCCTCGAATTCGACATACATTCACTGCGACGTCACCAACGAGGATCATATTCGAAACGCCGTCGACGAGACGGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G003610.1 (XP_057778004.1)
MATFSTLSALTRRLEGKVALVTGGATGIGECTAKLFSKHGAKVVITDVQDELGQSVVKQIGASNSTYIHCDVTNEDHIRNAVDETVSAYGKLDIMVNNAGIADPPKPRIADNHKADFERVLAVNVTGVFLGMKHAARVMIPARRGAIVSMASVSSGMGGAATHAYTTSKHAVLGLTRNLAVELGQFGIRVNCLSPYACATDLSKKYLELDDEALEQFMVSMANLKGTTLKAADVANAALFLASDEAQYVSGQNLFIDGGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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