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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004043`

染色体: Chr08 坐标: 48908104-48916004 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004043`
名称	SmilChr08G004043
描述	aminopeptidase P2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48908104 - 48916004 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996923`
GeneID	`130996923`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996923`
原始查询	`LOC130996923`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aminopeptidase P2
产物	aminopeptidase P2
Arabidopsis	`AT3G05350` (AT3G05350) Metallopeptidase M24 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819699] identity=72; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0205700` - identity=67.2; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0070006 (metalloaminopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00557 (Peptidase_M24); PF01321 (Creatinase_N); PF16188 (Peptidase_M24_C); PF16189 (Creatinase_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996923

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778182.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778182.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778182.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778182.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48909186`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C58
`Chr8:48909186`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C58
`Chr8:48909408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B107
`Chr8:48911669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B60,C14,C39
`Chr8:48912529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:48914404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B51,B52,C10
`Chr8:48915155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:48915165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:48915314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778182.1

709 aa

354

709

Creatinase_N

Creatinase_N_2

Peptidase_M24

Peptidase_M24_C

PF01321 Creatinase_N 96-209 aa PF16189 Creatinase_N_2 230-416 aa PF00557 Peptidase_M24 418-635 aa PF16188 Peptidase_M24_C 647-706 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778182.1`	Pfam	`PF01321`	Creatinase_N	Domain	96	209	6.1e-18	66.3	Creatinase/Prolidase N-terminal domain
`XP_057778182.1`	Pfam	`PF16189`	Creatinase_N_2	Domain	230	416	2.5e-46	158.4	Creatinase/Prolidase N-terminal domain
`XP_057778182.1`	Pfam	`PF00557`	Peptidase_M24	Domain	418	635	2.1e-48	165.6	Metallopeptidase family M24
`XP_057778182.1`	Pfam	`PF16188`	Peptidase_M24_C	Domain	647	706	6.9e-27	93.9	C-terminal region of peptidase_M24

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922199.1
ATTTTCTGCATAACAAACAATTTTCCCATAAAGAACAAAGCATGAGAAGGGAAACCCTACCCAAAATTTTATAAATTTCAATCAAAGTTTGCAACTTCAGCTGACAACTAGATGGATTTTTCTTCCATATTTGCATTAGTAGATAATTAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAGATAATTGGTGCAAATAATTAGGCTCATCTCCCGCAAAGCAATAGCACAGTTTTGCGTCTTCTTCTTCCCTTGCGTGTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996923
ATGGAGTCTGCCCTATCTTTCTCCACCGCTAGAATGCTTGCTCGCTCCCCCTTTCAACTTCACGGCCGGAGCCGCTTCGGCCTCCTCAACATATACCCCCAATTTCGCCGCAATATCAATTATTACCTCCCGAGATTCCCCTTCAAATCACACGCTGCTCACATCCTCCAGGTTTCCGCCTCCATAACTGCCAGGCCTTCCTCGGAGCTGCGGAAGAAGCCTAACAACTCTGAGCCCGACCACAAGCTCGCCGCTATACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778182.1
MESALSFSTARMLARSPFQLHGRSRFGLLNIYPQFRRNINYYLPRFPFKSHAAHILQVSASITARPSSELRKKPNNSEPDHKLAAIRELFIRPDINIDAYIVPSQDAHQSEFIAECYTRRAYISGFTGSAGTAVVTKNKAALWTDGRYFLQAEQQLPSSWILMRAGNLGVPTVSEWLNGVLAPGSRVGIDPFLFSSDSADELKEAISQKNHELVYVYDVNLVDEIWKESRPQPPNRLVRVHDLKYAGVDVSSKLSSLRSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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