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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004084`

染色体: Chr08 坐标: 49468558-49471416 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004084`
名称	SmilChr08G004084
描述	mevalonate kinase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49468558 - 49471416 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996940`
GeneID	`130996940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996940`
原始查询	`LOC130996940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mevalonate kinase-like
产物	mevalonate kinase-like
Arabidopsis	`AT5G27450` (MK) mevalonate kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832804] identity=68.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0329300` - identity=59.4; qcov=1.02; evalue=1.1e-160; confidence=high
GO	GO:0004496 (mevalonate kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008299 (isoprenoid biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00288 (GHMP_kinases_N); PF08544 (GHMP_kinases_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778208.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778208.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778208.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778208.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49469112`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr8:49469112`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr8:49469404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:49470372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr8:49470508`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B11,B47,C46,C74
`Chr8:49470508`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B11,B47,C46,C74
`Chr8:49470561`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A5,B22,B42,B43,B60,C2,C25,C45,C50,C61
`Chr8:49471169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778208.1

387 aa

194

387

GHMP_kinases_N

GHMP_kinases_C

PF00288 GHMP_kinases_N 125-211 aa PF08544 GHMP_kinases_C 294-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778208.1`	Pfam	`PF00288`	GHMP_kinases_N	Domain	125	211	1.3e-10	42.1	GHMP kinases N terminal domain
`XP_057778208.1`	Pfam	`PF08544`	GHMP_kinases_C	Domain	294	357	3.6e-08	34.4	GHMP kinases C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922225.1
GTGACCACGCGCGAGTAAACCCCCACCAACGAAAATGGGGTCTCATTCAAAGTTGACACCCTACGCTTTTGGAATTCTCCGCCATTGGCAGCCCGCCATTCACACACTCACACACACACAAAGAAACACATTACACATTGCTGCTCAATAAAGCCCTAGCTGAGCTGATTTGATCCTGAAAGAGACGGAATAGTATGGAGGTCAGAGCCAGAGCGCCTGGGAAAATCATACTCGCCGGCGAGCACGCCGTCGTTCACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996940
ATGGAGGTCAGAGCCAGAGCGCCTGGGAAAATCATACTCGCCGGCGAGCACGCCGTCGTTCACGGATCCACCGCCGTCGCCGCCGCCATCGATCTCTACACTTATGTATCTCTCCGCTTCCCCACTCCCGAGGATAACGACGATGCACTAAAACTCCAGCTCAAGGATGTGGACTTGGAATTTTCTTGGCCAGTTGGAAAGCTTAAGGAAGTTCTGCCTGAACTGGGCGGCAAGTCTGCTTCCTCACCTTCATCATGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778208.1
MEVRARAPGKIILAGEHAVVHGSTAVAAAIDLYTYVSLRFPTPEDNDDALKLQLKDVDLEFSWPVGKLKEVLPELGGKSASSPSSCSLETAKAIDALVEELNLADAKIGLASGISAFLWLYTSIHGNKPAKVVVNSELPLGSGLGSSAALCVALSAALLALSDSLKLDFSHQGWQTFGDSELDLVNKWAFEGEKMIHGRPSGIDNTVSTFGNMIKFRSGELTRIKTNMPLKMLVTNTKVGRNTRALVAGVSERAARHGGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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