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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000395`

染色体: Chr08 坐标: 2773144-2774048 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G000395`
名称	SmilChr08G000395
描述	uncharacterized SmilChr08G000395
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2773144 - 2774048 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997125`
GeneID	`130997125`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997125`
原始查询	`LOC130997125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
拟南芥	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=22.18; qcov=0.91; evalue=8.77e-10; confidence=weak
水稻	`Os01g0930300` - identity=23.11; qcov=0.91; evalue=3.16e-14; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997125

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质基质	0.80000	`XP_057778370.1`
2	细胞质	0.60000	`XP_057778370.1`
3	内质网	0.20000	`XP_057778370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2773171`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B117,B124,B15,B28,B57,B79,C29,C4
`Chr8:2773174`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B117,B124,B15,B28,B57,B79,C29,C4
`Chr8:2773183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr8:2773361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:2773510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr8:2773595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:2773678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:2773702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:2773703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr8:2773755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:2773918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C87,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778370.1

278 aa

139

278

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 3-70 aa PF13456 RVT_3 177-258 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057778370.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	3	70	7.5e-14	52.9	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057778370.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	177	258	2.5e-08	34.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922387.1
ATGAAATGGTGGAGCAAGCTCGTCTGGAATTTATCGATTCCTCCAAAGGCACGTGTGATGTTATGGAGAGCCTTCATGAATGTTATTCCGACCGCTCAAAATCTGAGGGAGCATCATGTACCTGTTGACGGAATATGTGAGTGCTGTGGGAGCAGATGGGATTCGACGGAACATAGTTTGGTTTTTTGCATGGGAGTTCGGAAGTCGTGGAAAGATAGTAGATATTGGCAGATCATGTCAAAGGCGGAGGGGCTGACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778370.1_40674
ATGAAATGGTGGAGCAAGCTCGTCTGGAATTTATCGATTCCTCCAAAGGCACGTGTGATGTTATGGAGAGCCTTCATGAATGTTATTCCGACCGCTCAAAATCTGAGGGAGCATCATGTACCTGTTGACGGAATATGTGAGTGCTGTGGGAGCAGATGGGATTCGACGGAACATAGTTTGGTTTTTTGCATGGGAGTTCGGAAGTCGTGGAAAGATAGTAGATATTGGCAGATCATGTCAAAGGCGGAGGGGCTGACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778370.1
MKWWSKLVWNLSIPPKARVMLWRAFMNVIPTAQNLREHHVPVDGICECCGSRWDSTEHSLVFCMGVRKSWKDSRYWQIMSKAEGLTLMQIAWAIHEEFTCEEYEVWAIMVWQVWVLKCRSKHEKMRVMNEVTENDCLMLWESFQRAKSAYALNTVMGLEYGDKKWLKPKRGEYRVDVDVLYDESTQAFGVGVIARDEHGTIIAALAKKTRPTSNTMVAEVMAVVEGIVFSVEGDLQPIRIFTDSMLAARVMVNPAEEAAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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