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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002622`

染色体: Chr08 坐标: 25600037-25604616 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002622`
名称	SmilChr08G002622
描述	glutamate dehydrogenase A
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25600037 - 25604616 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997261`
GeneID	`130997261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997261`
原始查询	`LOC130997261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate dehydrogenase A
产物	glutamate dehydrogenase A
Arabidopsis	`AT5G07440` (GDH2) glutamate dehydrogenase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830635] identity=86.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0543900` (OsGDH2) - identity=82.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004352 (L-glutamate dehydrogenase (NAD+) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006538 (L-glutamate catabolic process)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00208 (ELFV_dehydrog); PF02812 (ELFV_dehydrog_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778509.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778509.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057778509.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057778509.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25600819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25603775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:25604314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778509.1

411 aa

206

411

ELFV_dehydrog_N

ELFV_dehydrog

PF02812 ELFV_dehydrog_N 33-159 aa PF00208 ELFV_dehydrog 176-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778509.1`	Pfam	`PF02812`	ELFV_dehydrog_N	Domain	33	159	5.6e-50	169.1	Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation domain
`XP_057778509.1`	Pfam	`PF00208`	ELFV_dehydrog	Domain	176	408	3.5e-84	283.0	Glutamate/Leucine/Phenylalanine/Valine dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922526.1
TGGATAGCATTTCCCCTAAATACGGCCTGGCCACGTTTGATCCTACCCAATCAACAAAAGCAGCTGCTCATGAAAATACTTACTTCAAATTTTGGCCCTATTAATCTAACCGTCATTTCCTCAGAATCGCAAAGTTTTTTGGTTTTTTGTTTATTTATCGGGCAAGTAAAATTGATTTTGTTTGCATCAGCATTCAGCAGTCAGTACCCTACAAAACCAAATATATGGCCCACCCCCACCCCCCATGAATACATGTGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997261
ATGAATGCTCTCGCCGCCACTAATCGCAACTTCAGGCAAGCGGCGCGCATTCTCGGTCTTGACAGTAAGATTGAGAAGAGTCTTTTGATCCCGTTTAGAGAGATTAAGGTGGAGTGCACGATTCCAAAAGATGATGGAACGCTGGTTTCCTACGTTGGATTCAGAGTGCAGCATGATAATTCCCGTGGGCCCATGAAAGGAGGGATCAGATATCATCCAGAGGTTGACCCTGATGAAGTGAATGCTCTTGCTCAATTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778509.1
MNALAATNRNFRQAARILGLDSKIEKSLLIPFREIKVECTIPKDDGTLVSYVGFRVQHDNSRGPMKGGIRYHPEVDPDEVNALAQLMTWKTAVVDIPYGGAKGGIGCTPKELSISELERLTRVFTQKIHDLIGVNTDVPAPDMGTNAQTMAWILDEYSKFHGYSPAVVTGKPIDLGGSLGREAATGRGVVYATEALLAEHGKSIKGLTFAIQGFGNVGSWAARLFHERGGKVVAVSDITGAVRNPNGIDIQALIQHKETT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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