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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002703`

染色体: Chr08 坐标: 26601037-26605029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002703`
名称	SmilChr08G002703
描述	probable alkaline/neutral invertase F
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26601037 - 26605029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997334`
GeneID	`130997334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997334`
原始查询	`LOC130997334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable alkaline/neutral invertase F
产物	probable alkaline/neutral invertase F
Arabidopsis	`AT4G09510` (CINV2) cytosolic invertase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826535] identity=74.8; qcov=0.775; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0550600` (OsNIN8) - identity=71.4; qcov=0.838; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004575 (sucrose alpha-glucosidase activity); GO:0005987 (sucrose catabolic process); GO:0033926 (endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase activity)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12899 (Glyco_hydro_100)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778602.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778602.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057778602.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778602.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26602581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:26602657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B32
`Chr8:26602796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B32,B85
`Chr8:26602944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:26603307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr8:26603654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B31,C3
`Chr8:26604427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:26604506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B37
`Chr8:26604585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:26604623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:26604725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778602.1

605 aa

302

605

Glyco_hydro_100

PF12899 Glyco_hydro_100 140-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778602.1`	Pfam	`PF12899`	Glyco_hydro_100	Repeat	140	578	1.1e-211	703.9	Alkaline and neutral invertase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922619.1
ATCGCCTGCATTTCTCTCCTGTTTCTCTATGCGAAGTTAAAACCTTTAAAATTTTAACTTTTTATAATCAAGCGTCTTTGATACATTTCATGCAGAACTGTATCCAGCCGAACCGTAGGAAACTACTTCATTGATCACCACCCCCTTCATAAATACTCCGTGATTTATCATTTCTGCATGAGTTTACTCCCAGTTTTCCTCTTCTCTCTCTCTCTCTAATACTCTATCTCTCCTACCACAACTCTATACTTCCTAACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997334
ATGTCTCCGGCGTCTTCTCTCGAGGTCATCGCCGATCGTTCCGATCTGTTACTGGGAAACCTTCCGTCGGAGGAAACAGAAATTCCGGAAACTGTCGCCGATGCGTGGAAGAATATCGTCCGCGACGTTTCGACTACTCGCTCCGATCTCGGTATCTCAGCTGACACGGTGGAGAATACCGGAAAACTTCGCAAGGACAACGTGAAATTGAGCGTAAATGTGGTGTTCCCCAGCAGTTCCAACGGTGGAACGGCAGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778602.1
MSPASSLEVIADRSDLLLGNLPSEETEIPETVADAWKNIVRDVSTTRSDLGISADTVENTGKLRKDNVKLSVNVVFPSSSNGGTADSGESEVVANTSGGKTTSVLKPSPSVGMSLENHMDSPIGNGGGENGSAASMIEEAWELLSKSYVYFKGQRVGTIAANDDPGSETLNYNQVFVRDFVPSGLACLMRNDADVEIVKNFLLKTLHLQGWEKRIDNFTLGEGVMPASFKVIQDPIRQKEVLQADFGGSAIGRVAPVDSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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