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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002725`

染色体: Chr08 坐标: 26883322-26886011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002725`
名称	SmilChr08G002725
描述	cyclic pyranopterin monophosphate synthase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26883322 - 26886011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997353`
GeneID	`130997353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997353`
原始查询	`LOC130997353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic pyranopterin monophosphate synthase, mitochondrial
产物	cyclic pyranopterin monophosphate synthase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G01290` (CNX3) cofactor of nitrate reductase and xanthine dehydrogenase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839445] identity=54.8; qcov=1.14; evalue=8.93e-86; confidence=high
Rice	`Os04g0460500` (OSJNBa0072F16.9) - identity=63; qcov=0.879; evalue=2.64e-82; confidence=high
GO	GO:0006777 (Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01967 (MoaC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778628.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057778628.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778628.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778628.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26883843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B51,B60,C35
`Chr8:26885356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr8:26885707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:26885743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:26885756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:26885782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778628.1

231 aa

116

231

MoaC

PF01967 MoaC 89-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778628.1`	Pfam	`PF01967`	MoaC	Domain	89	224	6.7e-53	179.0	MoaC family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922645.1
TTATAAACACAATTTGATGTATTAATAATTTAATACCAAGTTATATCATTAATAAAGGGAAAAAAAAAATTAATGATGCGGTTTCCATAAATCCACCATTTTTGCTGAATTAGTTTATAAAATTTCACTCCAATTCCAATTATATCCTTGCAATTGAATAAAATTACATTTACTTTGTTTTTTATATATATAAAGATAAAGATTTATTCATCTACTTTTTTCATAAATAAAAAAACAGAGAAGAATTATATACTAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997353
ATGTTTCTTCGTCGATTTGCAACGATACTGAAGCCTTTTCCGAGGGTTAGATTCTTCAGCAGTGACGGCAGCCATGATTTTGCCAAAACTATCGCCGAGCTCAATCAGGAAATGGAGTTTGTGTTTGGTGCACCTCCCCCGTCATCCCTTGACAGTCCGACTCTAGATCAAGAATCGCATGTTGTAGCCAAAGGTGTCAATGGACAACAAGCGCCTGCGCCTCCTTCTGGATTGAGTCACATTGATAGCAAAGGCGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778628.1
MFLRRFATILKPFPRVRFFSSDGSHDFAKTIAELNQEMEFVFGAPPPSSLDSPTLDQESHVVAKGVNGQQAPAPPSGLSHIDSKGEARMVDISSKEITKRVALASCKVVLGEKVFGLVSANQMEKGDVLGVAKIAGVCGAKQTSNLIPLCHNINLSRVHVDLALNHRDFSIEIRGEAASTGKTGVEMEALTAVTVAGLTVYDMCKAASKDIVITDVRLEQKSGGKSGDWSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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