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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001915`

染色体: Chr08 坐标: 16671854-16673007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001915`
名称	SmilChr08G001915
描述	uncharacterized SmilChr08G001915
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16671854 - 16673007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998128`
GeneID	`130998128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998128`
原始查询	`LOC130998128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757]; symbol=AT2G41590; hit=AT2G41590; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757]; symbol=AT2G41590; hit=AT2G41590; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G41590` (AT2G41590) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757] identity=23.29; qcov=0.846; evalue=1.52e-19; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=29.03; qcov=0.53; evalue=1.44e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998128

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779545.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779545.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16671931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:16671967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B16,B21,B22,C62
`Chr8:16671973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B16,B21,B22,C62
`Chr8:16671988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B16,B21,B22,C62
`Chr8:16672004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B123
`Chr8:16672004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:16672011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B101,B25
`Chr8:16672043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,C13,C23,C38
`Chr8:16672082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B10,B91,C18,C27,C31,C46,C56,C65,C71
`Chr8:16672121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr8:16672148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:16672151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779545.1

345 aa

172

345

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 32-107 aa PF14392 zf-CCHC_4 174-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779545.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	32	107	1.2e-17	64.1	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057779545.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	174	217	2.1e-16	60.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923562.1
ATGGAGGACCAGATGGCCAATCTCCATATCTCCGAAGAAGATGATGAACTTGTTCTTGATGATGAGATCACTGGCGACTCTAATGTCACAGTCGATTTATGTTTAGTAGGGAGGTTCCTCACCGATCAAACGATCAATTTCCCTTTGATGCGAAGTCGCCTGGCTAGTGTTTGGAGACCTGGAAAAGGAGTTTTTGTTAAGGACATCGGGCAAGGGCGGTATATTTTCCAATTTTTCCATGAGATCGATCTGATAAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057779545.1_42772
ATGGAGGACCAGATGGCCAATCTCCATATCTCCGAAGAAGATGATGAACTTGTTCTTGATGATGAGATCACTGGCGACTCTAATGTCACAGTCGATTTATGTTTAGTAGGGAGGTTCCTCACCGATCAAACGATCAATTTCCCTTTGATGCGAAGTCGCCTGGCTAGTGTTTGGAGACCTGGAAAAGGAGTTTTTGTTAAGGACATCGGGCAAGGGCGGTATATTTTCCAATTTTTCCATGAGATCGATCTGATAAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779545.1
MEDQMANLHISEEDDELVLDDEITGDSNVTVDLCLVGRFLTDQTINFPLMRSRLASVWRPGKGVFVKDIGQGRYIFQFFHEIDLIRVYDGGPWAFGNFPLILHRLKRGEFPLQVPLDHLSFWVQIHDLPAGFLTEGVGRVLGNFIGKFLEYDSTNSSGVWRQYMRVRCGICVDAPLKRFKKLKHKDGTSFVVNFKYERLNIFCFLCGRLGHSESFCELIFDPKMKESDREWGVWLKAADRRGLTLAGDKWIRGDESVIPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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