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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003687`

染色体: Chr08 坐标: 41179035-41183693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003687`
名称	SmilChr08G003687
描述	uncharacterized SmilChr08G003687
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41179035 - 41183693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998475`
GeneID	`130998475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998475`
原始查询	`LOC130998475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.6; qcov=0.578; evalue=3.2e-43; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779878.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779878.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779878.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779878.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41179036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B83,C51,C87
`Chr8:41179055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C16,C53,C9
`Chr8:41179067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,A7,B114,B42,B47,C46,C64,C66,C74,C9,D4
`Chr8:41179076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:41182537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:41182552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B120
`Chr8:41182657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B120,C42
`Chr8:41182666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B35,C64,C66,C68
`Chr8:41182706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B77,B84,C43
`Chr8:41182706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B84,C43
`Chr8:41182733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A18,A2,A22,A23,A4,A5,B110,B112,B117,B119,B126,B129,B132,B23,B25,B29,B3,B31,B40,B42,B43,B5,B58,B59,B60,B62,B63,B70,B9,B91,B93,C19,C3,C32,C39,C45,C47,C52,C58,C61,C68,C7,C77,C84,C85,C86,D11,D2,D8
`Chr8:41182756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B79,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779878.1

374 aa

187

374

DUF7769

PF24964 DUF7769 7-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779878.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	7	61	6.2e-08	32.9	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923895.1
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTTCAAAACTCATCAAATGGGAAGCTTCACTATGGGACGGCCAAGGCAGCCACGGAGAAATGGGGATGCTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGCAAAAGACGAACATGCACAAGGTCAGTTGGTCACCGTTCAAAGCAAAAAAATCAGTAAGAGTCAAAGGAAAAGAGTGCACATAGATTTGGAACTCATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998475
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTTCAAAACTCATCAAATGGGAAGCTTCACTATGGGACGGCCAAGGCAGCCACGGAGAAATGGGGATGCTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGCAAAAGACGAACATGCACAAGGTCAGTTGGTCACCGTTCAAAGCAAAAAAATCAGTAAGAGTCAAAGGAAAAGAGTGCACATAGATTTGGAACTCATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779878.1
MTRRKDLSGAERQAIALFLLQNSSNGKLHYGTAKAATEKWGCCRSSIARLWKAAKDEHAQGQLVTVQSKKISKSQRKRVHIDLELISSLELHKRGTIRRLATGINCSKSTVGRWISKGLIRPHSSAIRPDLTAPNKLLRLRFSLQQVVYDRICNVLKFNNMHNVIHADEKWFYMSKVNHKFYLTPAEIDPHRTCKSKKFIKKIMFLCAVCRPLFDEDGSVLFDGKIEIFPFTEMVPAKRESKNREAGTLEEKPIQSITKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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