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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003934`

染色体: Chr08 坐标: 46988924-46989913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003934`
名称	SmilChr08G003934
描述	uncharacterized SmilChr08G003934
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46988924 - 46989913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998561`
GeneID	`130998561`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130998561`
原始查询	`LOC130998561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
拟南芥	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.78; qcov=0.733; evalue=1.32e-09; confidence=low
水稻	`Os10g0351414` - identity=32.57; qcov=0.778; evalue=1.55e-37; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998561

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	1.00000	`SmilChr08G003934.1`
2	细胞质基质	0.60000	`SmilChr08G003934.1`
3	细胞核	0.40000	`SmilChr08G003934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46988989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:46988998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:46989012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr8:46989014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B94,C23,C82
`Chr8:46989073`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A5,B70,B84,C53,C82
`Chr8:46989073`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A5,B70,B84,C53,C82
`Chr8:46989088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B70,B84,C53,C82
`Chr8:46989094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B84,C60
`Chr8:46989094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C60
`Chr8:46989110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B71,B89,C70,C82
`Chr8:46989114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4
`Chr8:46989150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A8,B1,B100,B102,B11,B111,B113,B121,B123,B127,B128,B129,B133,B140,B2,B20,B21,B29,B35,B45,B48,B50,B59,B6,B64,B81,B85,B88,B9,B91,B94,C1,C24,C25,C26,C29,C30,C34,C40,C49,C50,C53,C6,C62,C63,C67,C69,C76,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G003934.1

来源蛋白: XP_057779959.1

329 aa

164

329

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 5-228 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G003934.1` XP_057779959.1	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	5	228	1e-11	45.7	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923976.1
ATGAATTGCTTGGTTTGGAACTGTCGGGGGCTTGGGAACCAACCGACAGTTCGTCAGCTTGTTTGGCTTGTCAAACAAAAGAAGCCCGATTTGGTGTTCATTATGGAATCTAAACTTTTTGCAACTGATTGGACACCGGTTCTGTTGAAGCTTGGTTTTCTGAATCATTTTTTGGTTGACTGTGATTGTGATGGTGCTGGTAGAAAAGGTGGCTTGGGATTGTTGTGGTCGGAAGAGCTAAAAGTCGACATCAAATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G003934.1 (XP_057779959.1)
ATGAATTGCTTGGTTTGGAACTGTCGGGGGCTTGGGAACCAACCGACAGTTCGTCAGCTTGTTTGGCTTGTCAAACAAAAGAAGCCCGATTTGGTGTTCATTATGGAATCTAAACTTTTTGCAACTGATTGGACACCGGTTCTGTTGAAGCTTGGTTTTCTGAATCATTTTTTGGTTGACTGTGATTGTGATGGTGCTGGTAGAAAAGGTGGCTTGGGATTGTTGTGGTCGGAAGAGCTAAAAGTCGACATCAAATCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G003934.1 (XP_057779959.1)
MNCLVWNCRGLGNQPTVRQLVWLVKQKKPDLVFIMESKLFATDWTPVLLKLGFLNHFLVDCDCDGAGRKGGLGLLWSEELKVDIKSSSLHHILATVDNHLDPVWDFCGIYGWSRMEDHHLTWTLMTSLLVEVGERWLCGGDFNETLFHFEKKGGNMKPDARLNTFRSTVDACGLVDLGFVGDPYTWTNNQKGKDHILERLDRCFGNEAWMETFPGYMVSYLLRKSSDHRPLLLSVKSSGEEEKPHPRPFRFEAMWFKDER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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