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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004740

染色体: Chr08 坐标: 56778813-56779663 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G004740
名称SmilChr08G004740
描述putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12700, mitochondrial
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向56778813 - 56779663 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130998795
GeneID130998795
locus_tag-
NCBI 名称LOC130998795
原始查询LOC130998795

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12700, mitochondrial
产物putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12700%2C mitochondrial
拟南芥AT1G12700 (RPF1)
RNA processing FACTOR [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837825]
identity=32.16; qcov=0.817; evalue=1.34e-35; confidence=low
水稻Os11g0607100
-
identity=28.84; qcov=0.829; evalue=1.47e-22; confidence=low
GOGO:0005515 (protein binding)
KEGG-
PfamPF01535 (PPR); PF12854 (PPR_1); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130998795

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 线粒体 0.80000 SmilChr08G004740.1
2 叶绿体 0.40000 SmilChr08G004740.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:56778907 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B4
Chr8:56778955 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D5
Chr8:56779045 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr8:56779048 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A11,B30,B48,B51,C63
Chr8:56779087 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A11,B19,B2,B82
Chr8:56779180 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A13,B37
Chr8:56779183 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B33,B49,C32,C68
Chr8:56779197 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B136,B53,C41
Chr8:56779217 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B10,B121
Chr8:56779225 TCA T 2bp_deletion frameshift_variant 16 A19,B101,B104,B108,B111,B12,B136,B22,B24,B5,B53,B75,C23,C50,C59,D3
Chr8:56779228 A AGG 2bp_insertion frameshift_variant 16 A19,B101,B104,B108,B111,B12,B136,B22,B24,B5,B53,B75,C23,C50,C59,D3
Chr8:56779278 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004740.1
来源蛋白: XP_057780185.1
257 aa
N
1
128
257
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_2
PPR
C
PF13041 PPR_2 83-131 aa PF01535 PPR 88-114 aa PF12854 PPR_1 187-207 aa PF13812 PPR_3 188-236 aa PF13041 PPR_2 189-240 aa PF01535 PPR 193-218 aa PF12854 PPR_1 224-251 aa PF13041 PPR_2 226-252 aa PF01535 PPR 230-251 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 83 131 3.5e-32 111.0 PPR repeat family
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 88 114 1.3e-20 72.8 PPR repeat
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 187 207 1.6e-28 98.9 PPR repeat
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF13812 PPR_3 Repeat 188 236 5.5e-11 43.1 Pentatricopeptide repeat domain
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 189 240 3.5e-32 111.0 PPR repeat family
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 193 218 1.3e-20 72.8 PPR repeat
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 224 251 1.6e-28 98.9 PPR repeat
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 226 252 3.5e-32 111.0 PPR repeat family
SmilChr08G004740.1
XP_057780185.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 230 251 1.3e-20 72.8 PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057924202.1
AATCCTGGATTCGCCACTGGCGAGCTTCCCCAATTCTTCAACTTTTAATTTCAGTGGTCACAAAAACTATCCCAAGAATGAGGTCGAACCACGCCGCCATGTTTCTCGGTAGAATTTTCTCGAATTCTTCATCTAAATTCTCCACTTTTGCCATCGCCTCTCCACATTATCAATCATTTCTTCTACCCATTTTTCATTTTGATAATGCCAGTTGCCAAATGAGGAGACACTTCTCCGCCTATCATAGATTCGATTTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G004740.1 (XP_057780185.1)
ATGAGGTCGAACCACGCCGCCATGTTTCTCGGTAGAATTTTCTCGAATTCTTCATCTAAATTCTCCACTTTTGCCATCGCCTCTCCACATTATCAATCATTTCTTCTACCCATTTTTCATTTTGATAATGCCAGTTGCCAAATGAGGAGACACTTCTCCGCCTATCATAGATTCGATTTTGAATCTATACGTGAGCCCAATGATGCCGTCGCTCTATTTCGGGATATGATGAGAACAAAGCCGCTTCCTTCTATTACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G004740.1 (XP_057780185.1)
MRSNHAAMFLGRIFSNSSSKFSTFAIASPHYQSFLLPIFHFDNASCQMRRHFSAYHRFDFESIREPNDAVALFRDMMRTKPLPSITVFTKLLSTVVKLKQYSAALHLFDEMLQRDAPVNHYTLSIAIDGCGRLKRPDFGFAILGIFFKRGFEPTVVTFNILVKGLLFVERIPKAAKLLGKLSAYQLCEPDEYMYRTIIHGLCKAGDLLQVIDLLCSLEKGKGSCKPNVYAYNIVIDGLCKDGKVNDALQLFATLDDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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