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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004167`

染色体: Chr08 坐标: 50974619-50976750 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004167`
名称	SmilChr08G004167
描述	protein BRI1-5 ENHANCED 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50974619 - 50976750 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998903`
GeneID	`130998903`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130998903`
原始查询	`LOC130998903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BRI1-5 ENHANCED 1-like
产物	protein BRI1-5 ENHANCED 1-like
拟南芥	`AT2G45400` (BEN1) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819146] identity=35.45; qcov=0.97; evalue=9.8e-47; confidence=medium
水稻	`Os07g0602000` (DHFR) - identity=46.63; qcov=1.0; evalue=1.26e-94; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF07993 (NAD_binding_4); PF13460 (NAD_binding_10); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998903

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	1.00000	`XP_057780325.1`
2	细胞质基质	1.00000	`XP_057780325.1`
3	细胞核	0.20000	`XP_057780325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50974789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:50975526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,D6
`Chr8:50975625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B115,C60
`Chr8:50976472`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C28,C33
`Chr8:50976472`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C28,C33
`Chr8:50976551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780325.1

328 aa

164

328

NmrA

Epimerase

GDP_Man_Dehyd

3Beta_HSD

NAD_binding_4

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 6-127 aa PF01370 Epimerase 7-251 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 9-84 aa PF01073 3Beta_HSD 9-179 aa PF07993 NAD_binding_4 9-196 aa PF13460 NAD_binding_10 11-137 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	6	127	4.7e-09	37.0	NmrA-like family
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	7	251	2.1e-22	80.4	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	9	84	4.5e-09	37.0	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	9	179	2.3e-14	53.8	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	9	196	7.6e-10	39.1	Male sterility protein
`XP_057780325.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	11	137	3.7e-10	40.7	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924342.1
AGGATCCCACCAAATTATCCTTGAGTCCCACCAAGCTCAATTATGCACACAAATTTACACTTATTTGTACCCACACACATACTCGATAAGGAATTCAACAGATATTTGGATACGATATAATATATTGGACTAAAATTTGTCAAATTAAGAAATCAGAATCAAGAAATGGAGAAGAGTGTGCAGGTGTGTGTAACTGGAGGTGCTGGTTATATTGCCTCTTTTCTCATCAAGCATCTTTTAGAGAGAGGCTACACTGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780325.1_45368
ATGGAGAAGAGTGTGCAGGTGTGTGTAACTGGAGGTGCTGGTTATATTGCCTCTTTTCTCATCAAGCATCTTTTAGAGAGAGGCTACACTGTTCATGCAACTCTTCGAAGTTTGAGCCATGCTTCAAAAGTGGGATTATTGAAAGGGCTTGATCATGCAGAAACAAGATTGAAACTGTTTGAAGGTGATATATATAATCCTACTGAATTTGCAGCTGCTATTCATGGCTGTGAGTTTGTGTTTCACGTAGCTACGCCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780325.1
MEKSVQVCVTGGAGYIASFLIKHLLERGYTVHATLRSLSHASKVGLLKGLDHAETRLKLFEGDIYNPTEFAAAIHGCEFVFHVATPLQHDGGQYKSTSEAAVAAVKIIAESCLKSKTVKKLIYTASVVAASPSKSDASGYEDTMDESCWTPLDLSYEMFSDYINSKTLAEKEILSYNGLGIEVVSLACGLVGGETIQSFLSVSMSTLISQALSDGTFYKGLRALEDLDSKVPIAHIQDVIDAHIFAMENSDMNGRFLVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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