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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004053`

染色体: Chr01 坐标: 58975835-58977641 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004053`
名称	SmilChr01G004053
描述	probable aspartic proteinase GIP1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58975835 - 58977641 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999077`
GeneID	`130999077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999077`
原始查询	`LOC130999077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartic proteinase GIP1
产物	probable aspartic proteinase GIP1
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=38.9; qcov=0.998; evalue=8.69e-91; confidence=medium
Rice	`Os05g0403300` - identity=38.9; qcov=1.04; evalue=8.58e-92; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057780541.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057780541.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057780541.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780541.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58976252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A22,A5,C78
`Chr1:58976431`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B73
`Chr1:58976431`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B73
`Chr1:58976458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C53,C61,C78
`Chr1:58976462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:58976483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B16
`Chr1:58976516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B64,B77,C1,C41
`Chr1:58976569`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,B112,B122,B133,B68,C14,C26,C5
`Chr1:58976571`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,B112,B122,B133,B68,C14,C26,C5
`Chr1:58977167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B124,C53,C61,C78
`Chr1:58977356`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A18,A22,A3,A9,B1,B104,B125,B127,B25,B32,B37,B4,B49,B51,B55,B69,B79,B84,B85,B92,C16,C36,C38,C39,C71,C75,D1,D6,D7
`Chr1:58977412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780541.1

435 aa

218

435

TAXi_N

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 42-215 aa PF14541 TAXi_C 257-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780541.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	42	215	9.5e-25	88.5	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057780541.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	257	416	7.7e-50	169.5	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924558.1
AATCAAATGTATTAAATTCACCCCACTGACACATAACATGTTACATGTGCTCGTCTACTTGAAAGTCTACAAACGAGCATAATATATATTTTAAAGAAACACTAAACTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGCAAAATCTTAAAAATTAAAAAAAAAAGTCACAAGCAACATAAATAAAAAATAAAAAAAATCAGATGTCAAAGTGTGAAATTCCTAAGTCTTAAAACCAATACTATAAATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999077
ATGTCAACCCCGCTTATTGCAACCACCTTACTAGTTGTTGCAAATTTAATTTCCTTCCAATCTTGTTGGGCTGAATCAGCAACCCTCTTCAGCCCCATAAGAAAAGATGAAAGCAGCAACTTATACAGCATGTTGATTTACATGAAAACCCCTCTACAGGCGTCGCAGCTCCACCTCGACTTAGGCTCCTTCCTGCCGTGGTACGACTGCAGCCGCCACTACAAGTCGTCGTCGTACGCTCCCGTCATCTACAACTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780541.1
MSTPLIATTLLVVANLISFQSCWAESATLFSPIRKDESSNLYSMLIYMKTPLQASQLHLDLGSFLPWYDCSRHYKSSSYAPVIYNSSLCIDLHTNVYGNCFDKPRPGCANDTCFDFPQNPVTLKGGMGSIITDKFTLPSINTNTNTSPLQIVLSCTFPNKYSKIYRGLAKGSAGLASLGRFNYSLSALIARGSNSPWIFALCLPNSSNSTGIALFNSAGPYNFSPRIDVSKLLSYTPLILAAKGAETDTMYWYKSPEYYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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