当前解析结果
SmilChr08G004410| 统一基因 ID | SmilChr08G004410 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004410 |
| 描述 | salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 53771219 - 53773199 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999135 |
|---|---|
| GeneID | 130999135 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130999135 |
| 原始查询 | LOC130999135 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 1 |
| 产物 | salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 1 |
| 拟南芥 | AT1G68400 (AT1G68400)leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843169] identity=63.75; qcov=0.427; evalue=1.55e-26; confidence=low |
| 水稻 | Os12g0145900- identity=50.91; qcov=0.297; evalue=3.21e-15; confidence=weak |
| GO | GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0006468 (protein phosphorylation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999135 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质 | 0.80000 | SmilChr08G004410.3 |
| 2 | 细胞质基质 | 0.60000 | SmilChr08G004410.3 |
| 3 | 内质网 | 0.40000 | SmilChr08G004410.1 |
| 4 | 线粒体 | 0.20000 | SmilChr08G004410.2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
SmilChr08G004410.1PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 87-151 aa
SmilChr08G004410.2PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 87-149 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr08G004410.1XP_057780615.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 87 | 151 | 4.7e-06 | 26.8 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
SmilChr08G004410.2XP_057780616.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 87 | 149 | 1.5e-05 | 25.2 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”;序号在当前参考发布内固定,来源 accession 同时保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。