当前解析结果
SmilChr08G004430| 统一基因 ID | SmilChr08G004430 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004430 |
| 描述 | (-)-isopiperitenone reductase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 54003859 - 54004844 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999153 |
|---|---|
| GeneID | 130999153 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130999153 |
| 原始查询 | LOC130999153 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | (-)-isopiperitenone reductase-like |
| 产物 | (-)-isopiperitenone reductase-like |
| 拟南芥 | AT3G61220 (SDR1)NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825294] identity=51.61; qcov=0.879; evalue=4.74e-43; confidence=medium |
| 水稻 | Os04g0532400- identity=49.58; qcov=0.85; evalue=1.57e-33; confidence=medium |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999153 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质基质 | 1.00000 | SmilChr08G004430.1 |
| 2 | 细胞质 | 0.40000 | SmilChr08G004430.1 |
| 3 | 过氧化物酶体 | 0.40000 | SmilChr08G004430.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:54004051 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr8:54004087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr8:54004092 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B118,B82,C23,C45 |
Chr8:54004092 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B118,B82,C23,C45 |
Chr8:54004110 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr8:54004154 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 97 | A10,A16,A18,A19,A2,A22,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B10,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B112,B117,B123,B124,B129,B131,B133,B135,B136,B138,B14,B22,B23,B24,B25,B29,B30,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B50,B54,B55,B57,B6,B60,B62,B63,B66,B67,B71,B74,B77,B8,B83,B85,B90,B92,B97,B98,C10,C11,C12,C17,C18,C19,C23,C25,C3,C34,C36,C37,C38,C43,C45,C49,C51,C55,C57,C59,C63,C67,C69,C72,C77,C80,C81,C83,C84,C85,D11,D2,D5,D7,D9 |
Chr8:54004341 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B128,B67,C33,C56 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”;序号在当前参考发布内固定,来源 accession 同时保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。