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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004439`

染色体: Chr08 坐标: 54069923-54073911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004439`
名称	SmilChr08G004439
描述	shaggy-related protein kinase theta
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54069923 - 54073911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999163`
GeneID	`130999163`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999163`
原始查询	`LOC130999163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shaggy-related protein kinase theta
产物	shaggy-related protein kinase theta
拟南芥	`AT4G00720` (SK32) shaggy-like protein kinase 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828023] identity=70.6; qcov=0.998; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os10g0521700` - identity=69.3; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999163

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G004439.1`
2	细胞质	0.80000	`SmilChr08G004439.1`
3	核质	0.20000	`SmilChr08G004439.1`
4	细胞质基质	0.20000	`SmilChr08G004439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54070192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B41
`Chr8:54070205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B2,D3
`Chr8:54070358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:54070397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B94,C2,C80
`Chr8:54070736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:54071049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C17,C41
`Chr8:54071444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B127,B41
`Chr8:54071681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:54071738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004439.1

来源蛋白: XP_057780645.1

445 aa

222

445

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 117-400 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 119-320 aa

SmilChr08G004439.2

来源蛋白: XP_057780646.1

443 aa

222

443

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 115-398 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 117-318 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004439.1` XP_057780645.1	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	117	400	1e-61	209.4	Protein kinase domain
`SmilChr08G004439.1` XP_057780645.1	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	119	320	1.6e-23	84.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`SmilChr08G004439.2` XP_057780646.1	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	115	398	1e-61	209.4	Protein kinase domain
`SmilChr08G004439.2` XP_057780646.1	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	117	318	1.6e-23	84.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924663.1
CCAAACTAAACAACTCCCCCGAATAGTCCGCTTCTCCCTCACCTCACCTAATAATAAATTCTTAAAAAAAAAAAAAAACCCATTTTCGTAAACTCGGATCCGCTCTGCGCCGTCGGATCTCATCATGATGGATGGACGGTGCAGAATCAAAGTCTGACCGCAAGTACGAAAACAAGGAGAAAAGAAAAATGGTGGGTCGGAAGGAATAATGATTAGGCCTTGAAGCTTTGACTGAAAGCGGAAATTGGGACAAAAAATAA...

XM_057924662.1
CGCTCTGCGCCGTCGGATCTCATCATGATGGATGGACGGTGCAGAATCAAAGTCTGACCGCAAGTACGAAAACAAGGAGAAAAGAAAAATGGTGGGTCGGAAGGAATAATGATTAGGCCTTGAAGCTTTGACTGAAAGCGGAAATTGGGACAAAAAATAAGATAGAGAGAGAGAGTTTCTTGTCTGAAAGAAGAGGTTTTTCCTGTCATTTATTTGGGATTTTTTTTTTTTTTTGGGTTTCTTTTGGAATTGCTTTTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004439.2 (XP_057780646.1)
ATGAATATGATGCGTCGGCTGAAGAGCATTGCTTCGGGGCGCACATCCGTTTCAGATCATGGTGGGGATTCTGGCATTAAAAGGGTGAAGGTGGAACAAGGAGATGTGGACGGTGAGCTGCCTGCAGAGTCGAACTCTACGGAAGCTGTTGCAGTCGCATCAGACGTGCATGAGCTACCGAAAGAGTTGCACGAAATGAAGATTCGAGGGGATGGAAACGATGACCATGATAACAGTGATATGGAGCCAACTGTTGTTAG...

SmilChr08G004439.1 (XP_057780645.1)
ATGAATATGATGCGTCGGCTGAAGAGCATTGCTTCGGGGCGCACATCCGTTTCAGATCATGGTGGGGATTCTGGCATTAAAAGGGTGAAGGTGGAACAAGGAGATGTGGACGGTGAGCTGCCTGCAGAGTCGAACTCTACGGAAGCTGTTGCAGTCGCATCAGACGTGCATGAGCTACCGAAAGAGTTGCACGAAATGAAGATTCGAGGGGATGGAAACGATGACCATGATAACAGTGTAAAGGATATGGAGCCAACTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004439.1 (XP_057780645.1)
MNMMRRLKSIASGRTSVSDHGGDSGIKRVKVEQGDVDGELPAESNSTEAVAVASDVHELPKELHEMKIRGDGNDDHDNSVKDMEPTVVSGNGTEPGQIIVTSIGGRNGEPKQVMSYMAERVVGTGSFGVVYQAKCLETGESVAIKKVLQDRRYKNRELQMMRLLNHPNIVQLKHFFYSTTDKNEVYLNLVLEFVPETVYRATRQYSRVNQYMPILNVQIYVYQICRALNYMHRIIGVCHRDIKPQNLLVNSQTHQLKLCD...

SmilChr08G004439.2 (XP_057780646.1)
MNMMRRLKSIASGRTSVSDHGGDSGIKRVKVEQGDVDGELPAESNSTEAVAVASDVHELPKELHEMKIRGDGNDDHDNSDMEPTVVSGNGTEPGQIIVTSIGGRNGEPKQVMSYMAERVVGTGSFGVVYQAKCLETGESVAIKKVLQDRRYKNRELQMMRLLNHPNIVQLKHFFYSTTDKNEVYLNLVLEFVPETVYRATRQYSRVNQYMPILNVQIYVYQICRALNYMHRIIGVCHRDIKPQNLLVNSQTHQLKLCDMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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