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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004505`

染色体: Chr08 坐标: 54654095-54657125 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004505`
名称	SmilChr08G004505
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54654095 - 54657125 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999227`
GeneID	`130999227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999227`
原始查询	`LOC130999227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2, mitochondrial
产物	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G23140` (NCLPP7) nuclear-encoded CLP protease P7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832378] identity=80.2; qcov=1; evalue=2.34e-145; confidence=high
Rice	`Os04g0525600` (OsClp7) - identity=71.8; qcov=0.88; evalue=3.37e-116; confidence=high
GO	GO:0004176 (ATP-dependent peptidase activity); GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006515 (protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins); GO:0009368 (endopeptidase Clp complex); GO:0051117 (ATPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00574 (CLP_protease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780716.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057780716.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780716.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780716.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54655759`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B112,B129,B13,B29,B91,C14,C41
`Chr8:54656786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B54,B81,C9,D10
`Chr8:54656915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B130
`Chr8:54656917`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B128,B30,B37,C58
`Chr8:54656917`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B128,B30,B37,C58
`Chr8:54656918`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B118,B24,B62,C65,C70,C81,D9
`Chr8:54656923`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B101,B118,B24,B62,C65,C70,C81,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780716.1

242 aa

121

242

CLP_protease

PF00574 CLP_protease 43-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780716.1`	Pfam	`PF00574`	CLP_protease	Domain	43	222	2.3e-81	272.7	Clp protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093447.1
TGGTGACAATTTTAACTTATATAAAACTCAAAACAAAATTAGAAAGAATAATGTTTTGTAGAGAGAGAGTCACACTCACACACACATCCCTCTTCACTAGAATTCCCAAAACTGAAAATCAAAAACCCTAGCGATGATGCGAAGCCTCTTCTCCCGAAATCTAATCAACGTCGGCAAATCTTCGATAACATCCGCCACCGCTGCCGCCGGCGGCCGAAGGTGCTATGGCCTGGTACCAATGGTGATCGAGCATTCATCGA...

XM_057924733.1
ACTCAAAACAAAATTAGAAAGAATAATGTTTTGTAGAGAGAGAGTCACACTCACACACACATCCCTCTTCACTAGAATTCCCAAAACTGAAAATCAAAAACCCTAGCGATGATGCGAAGCCTCTTCTCCCGAAATCTAATCAACGTCGGCAAATCTTCGATAACATCCGCCACCGCTGCCGCCGGCGGCCGAAGGTGCTATGGCCTGGTACCAATGGTGATCGAGCATTCATCGAGAGGGGAGCGCGCCTATGACATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999227
ATGATGCGAAGCCTCTTCTCCCGAAATCTAATCAACGTCGGCAAATCTTCGATAACATCCGCCACCGCTGCCGCCGGCGGCCGAAGGTGCTATGGCCTGGTACCAATGGTGATCGAGCATTCATCGAGAGGGGAGCGCGCCTATGACATATTCTCTCGGTTGCTGAAAGAGCGCATCATTTGCATTAATGGCCCCATCTCCGACGACACCGCCCACGTCGTCGTCGCGCAGCTGCTCTTCCTCGAGTCGGAGAATCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780716.1
MMRSLFSRNLINVGKSSITSATAAAGGRRCYGLVPMVIEHSSRGERAYDIFSRLLKERIICINGPISDDTAHVVVAQLLFLESENPAKPIHMYLNSPGGAVTAGLAIYDTMQYIRSPINTICLGQAASMASLLLAAGAKGERRSLPNATIMIHQPSGGYSGQAKDISIHTKQIIRVWDALNALYCKHTGQSLEVIQTNMDRDYFMTADEAKEFGIIDEVINERPMALVADAVANEGKDKGSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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