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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004646`

染色体: Chr08 坐标: 55980015-55981690 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004646`
名称	SmilChr08G004646
描述	uncharacterized SmilChr08G004646
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55980015 - 55981690 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999361`
GeneID	`130999361`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999361`
原始查询	`LOC130999361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
拟南芥	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=28.41; qcov=0.721; evalue=1.21e-25; confidence=low
水稻	`Os06g0224900` - identity=28.18; qcov=0.696; evalue=1.1e-21; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999361

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亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	线粒体	1.00000	`SmilChr08G004646.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55980290`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr8:55980290`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr8:55980337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:55980349`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr8:55980349`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr8:55980354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:55980443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B103,B41,C25,C67
`Chr8:55980457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C60
`Chr8:55980670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:55980692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C27,D9
`Chr8:55980846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87
`Chr8:55980846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004646.1

来源蛋白: XP_057780873.1

359 aa

180

359

mTERF

PF02536 mTERF 42-201 aa PF02536 mTERF 81-323 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004646.1` XP_057780873.1	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	42	201	2e-33	116.4	mTERF
`SmilChr08G004646.1` XP_057780873.1	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	81	323	2e-33	116.4	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924890.1
GAGTGATATTGAAACTAAAAGCTTCTTCCCTTCCCTGCCATGGCGGCGCCGCTGCTTCAGAAACCCTCAATCCAGAAGCTTTGAATCCGTCCATTTACAGGCAAGTCGTTTATCATTTCCCCACACAAGTTCTATTTCTATCAAACATGATTGCAATTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATGCATAAACCCTAATTCATTCCTCTGCAACTCCAATACTCATTTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTCTCCACTTGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004646.1 (XP_057780873.1)
ATGATTGCAATTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATGCATAAACCCTAATTCATTCCTCTGCAACTCCAATACTCATTTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTCTCCACTTGGAGGGTGAAAAACCCTAACCCTGAAATCTATGATCTATTGCTCAACAAACACCAATTTCCTCCTGAATTAGCTTCAATAGCTTCATCGGGTTTACCTAAATCTAGAAGCCCCTTAGGAGTTGATACATTATTGTCATTCCTCAAAGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004646.1 (XP_057780873.1)
MIAIARRNLSCLCINPNSFLCNSNTHFFPSIHFFSTWRVKNPNPEIYDLLLNKHQFPPELASIASSGLPKSRSPLGVDTLLSFLKEKSFTATQLQKVVTYNPRILGFTIESINFKLKVFQSLGLSPKEIAKIIYENTSILRSSYENRIIPKLLMLKCLLGSDHDLARLLKRCSWFLAADLEKTLMPNMEILKSYSIPMVHILHFLHLRPRCFVVKPDIMQKSVVRAIEFGVPWTSGVFIQAVNLFTHTSEGMWEVKVQTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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