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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004769`

染色体: Chr08 坐标: 57014357-57018740 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004769`
名称	SmilChr08G004769
描述	linoleate 9S-lipoxygenase 6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57014357 - 57018740 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999426`
GeneID	`130999426`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999426`
原始查询	`LOC130999426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	linoleate 9S-lipoxygenase 6-like
产物	linoleate 9S-lipoxygenase 6-like
拟南芥	`AT3G22400` (LOX5) PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821808] identity=44.98; qcov=0.915; evalue=0.0; confidence=medium
水稻	`Os05g0304600` (OsLOX7) - identity=50.06; qcov=0.939; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016702 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen); GO:0034440 (lipid oxidation); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil00591 (Linoleic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00305 (Lipoxygenase); PF01477 (PLAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999426

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	内质网	0.40000	`XP_057780930.1`
2	细胞质基质	0.20000	`XP_057780930.1`
3	叶绿体	0.20000	`XP_057780930.1`
4	液泡	0.20000	`XP_057780930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57014377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C47,C86
`Chr8:57014382`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A11,A23,A9,B120,B15,B2,B53,B63,B91,B94,C43,C7,C74,C82
`Chr8:57014426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:57014433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:57014465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C74
`Chr8:57014494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C74,C82
`Chr8:57014514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C74,D11
`Chr8:57014541`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C43
`Chr8:57014541`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C43
`Chr8:57014544`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr8:57014544`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr8:57014555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780930.1

889 aa

444

889

PLAT

Lipoxygenase

PF01477 PLAT 121-188 aa PF00305 Lipoxygenase 202-867 aa

XP_057780931.1

887 aa

444

887

PLAT

Lipoxygenase

PF01477 PLAT 116-186 aa PF00305 Lipoxygenase 200-865 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057780930.1`	Pfam	`PF01477`	PLAT	Domain	121	188	3.3e-11	44.6	PLAT/LH2 domain
`XP_057780930.1`	Pfam	`PF00305`	Lipoxygenase	Domain	202	867	1.9e-261	870.1	Lipoxygenase
`XP_057780931.1`	Pfam	`PF01477`	PLAT	Domain	116	186	3e-11	44.8	PLAT/LH2 domain
`XP_057780931.1`	Pfam	`PF00305`	Lipoxygenase	Domain	200	865	1.9e-261	870.1	Lipoxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924947.1
ATGCCTTTAAAAACTTTGGAGTCCACAACCCATGAGTATAGCAAGATGAAGAAAAGGCACGGACAGAGAGCAACACGGCGAGGCTTGTGTTCAAGCCTCGCCCGGTGCCTGAGCCTGTGCCAAGGTGACGTGGCCGCCAGAAAAGTTCGGAGTTTCGGCACTCCCGGGAAGAACATCGTATACGGAGAGATCATCATCCAGGTAGGCCATGGAGAGTCAGGCCCCGGAAAAGCAGCCTCAGTTTGGTTGTATAGCGATTC...

XM_057924948.1
ATGCCTTTAAAAACTTTGGAGTCCACAACCCATGAGTATAGCAAGATGAAGAAAAGGCACGGACAGAGAGCAACACGGCGAGGCTTGTGTTCAAGCCTCGCCCGGTGCCTGAGCCTGTGCCAAGGTGACGTGGCCGCCAGAAAAGTTCGGAGTTTCGGCACTCCCGGGAAGAACATCGTATACGGAGAGATCATCATCCAGGTAGGCCATGGAGAGTCAGGCCCCGGAAAAGCAGCCTCAGTTTGGTTGTATAGCGATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780930.1_46067
ATGCCTTTAAAAACTTTGGAGTCCACAACCCATGAGTATAGCAAGATGAAGAAAAGGCACGGACAGAGAGCAACACGGCGAGGCTTGTGTTCAAGCCTCGCCCGGTGCCTGAGCCTGTGCCAAGGTGACGTGGCCGCCAGAAAAGTTCGGAGTTTCGGCACTCCCGGGAAGAACATCGTATACGGAGAGATCATCATCCAGGTAGGCCATGGAGAGTCAGGCCCCGGAAAAGCAGCCTCAGTTTGGTTGTATAGCGATTC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780931.1_46068
ATGCCTTTAAAAACTTTGGAGTCCACAACCCATGAGTATAGCAAGATGAAGAAAAGGCACGGACAGAGAGCAACACGGCGAGGCTTGTGTTCAAGCCTCGCCCGGTGCCTGAGCCTGTGCCAAGGTGACGTGGCCGCCAGAAAAGTTCGGAGTTTCGGCACTCCCGGGAAGAACATCGTATACGGAGAGATCATCATCCAGGTAGGCCATGGAGAGTCAGGCCCCGGAAAAGCAGCCTCAGTTTGGTTGTATAGCGATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780930.1
MPLKTLESTTHEYSKMKKRHGQRATRRGLCSSLARCLSLCQGDVAARKVRSFGTPGKNIVYGEIIIQVGHGESGPGKAASVWLYSDSNVDPVLGTGKGKLTQKAALQKGSIDEETDSSSRTKVLRYEVEFNVEPDFGAPGAFVVKNEHKHEFFLQNVSLQGDNNHIVHFECNSWIYPFHLTKQDRVFFPNTCYLPNQTPPSLMELRKDELARLRGNGTGERRKWEQIYDYDCYNDLGIPERSLGYGRPVLGGTQSFPYPR...

XP_057780931.1
MPLKTLESTTHEYSKMKKRHGQRATRRGLCSSLARCLSLCQGDVAARKVRSFGTPGKNIVYGEIIIQVGHGESGPGKAASVWLYSDSNVDPGTGKGKLTQKAALQKGSIDEETDSSSRTKVLRYEVEFNVEPDFGAPGAFVVKNEHKHEFFLQNVSLQGDNNHIVHFECNSWIYPFHLTKQDRVFFPNTCYLPNQTPPSLMELRKDELARLRGNGTGERRKWEQIYDYDCYNDLGIPERSLGYGRPVLGGTQSFPYPRRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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