当前解析结果
SmilChr08G000061| 统一基因 ID | SmilChr08G000061 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000061 |
| 描述 | 6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 356727 - 359313 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999683 |
|---|---|
| GeneID | 130999683 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130999683 |
| 原始查询 | LOC130999683 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like |
| 产物 | 6%2C7%2C8-trihydroxycoumarin synthase-like |
| 拟南芥 | AT4G31500 (CYP83B1)cytochrome P450, family 83, subfamily B, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829277] identity=46.51; qcov=0.994; evalue=2.95e-162; confidence=high |
| 水稻 | Os09g0275400- identity=38.57; qcov=0.99; evalue=3.91e-112; confidence=medium |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999683 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 内质网 | 1.00000 | XP_057781278.1 |
| 2 | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057781278.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:356935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C71,C85 |
Chr8:356974 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C71,C85 |
Chr8:357007 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B140,C2 |
Chr8:357015 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B27,B58,C20,D5 |
Chr8:357031 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B44,B83,C52,C61 |
Chr8:357082 |
T |
TTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C17,C86 |
Chr8:357082 |
T |
TTG |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C17,C86 |
Chr8:357084 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C17,C86 |
Chr8:357084 |
ACC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | C17,C86 |
Chr8:357102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,C80 |
Chr8:357121 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,C80 |
Chr8:357194 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057781278.1PF00067
p450 29-479 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057781278.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 29 | 479 | 3.6e-104 | 349.8 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。