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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000181`

染色体: Chr08 坐标: 1237352-1244110 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000181`
名称	SmilChr08G000181
描述	endochitinase A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1237352 - 1244110 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999793`
GeneID	`130999793`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999793`
原始查询	`LOC130999793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endochitinase A-like
产物	endochitinase A-like
Arabidopsis	`AT3G54420` (EP3) homolog of carrot EP3-3 chitinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824608] identity=58.9; qcov=1.03; evalue=2.08e-111; confidence=high
Rice	`Os04g0494100` (Cht5) - identity=63.6; qcov=1.01; evalue=8.62e-113; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0008061 (chitin binding); GO:0016998 (cell wall macromolecule catabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00182 (Glyco_hydro_19); PF00187 (Chitin_bind_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999793

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057781420.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057781420.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057781420.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781420.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1237461`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A14,A7,B35,B90,B92,C71
`Chr8:1237463`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A14,A7,B35,B90,B92,C71
`Chr8:1237470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C20,C8
`Chr8:1237473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C5
`Chr8:1237483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C9
`Chr8:1237506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B29,B72,B81
`Chr8:1237525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C79
`Chr8:1237528`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr8:1237528`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr8:1242860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:1242929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B128,C30
`Chr8:1242962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781420.1

262 aa

131

262

Chitin_bind_1

Glyco_hydro_19

PF00187 Chitin_bind_1 25-56 aa PF00182 Glyco_hydro_19 68-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781420.1`	Pfam	`PF00187`	Chitin_bind_1	Domain	25	56	8.5e-09	36.2	Chitin recognition protein
`XP_057781420.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	68	207	3.8e-51	174.8	Chitinase class I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925437.1
ATCCTTGCCTTAATCTCCACACCAACACAACATTTCCTCTCTCATCTCCAAACATGAAGCACTCTCTCACTATCTACACCCTTCTTGCTCTCCTTCTGGCCGCCGGAAACTACGTTTCCGGCCAGAACTGCGGCTGCGCTCCCAACCTCTGCTGCAGCCAATTCGGCTACTGCGGCACCACCAACGATTATTGTGGGCCCGGCTGCCGTTCGGGGCCGTGCACCGGTTCGTCGGGAGGGAATACAATTGCTAGTATAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999793
ATGAAGCACTCTCTCACTATCTACACCCTTCTTGCTCTCCTTCTGGCCGCCGGAAACTACGTTTCCGGCCAGAACTGCGGCTGCGCTCCCAACCTCTGCTGCAGCCAATTCGGCTACTGCGGCACCACCAACGATTATTGTGGGCCCGGCTGCCGTTCGGGGCCGTGCACCGGTTCGTCGGGAGGGAATACAATTGCTAGTATAGTGACGGATAATTTCTTCAATGGAATTGCTAATCAGGCGCCGGCGGGCTGCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781420.1
MKHSLTIYTLLALLLAAGNYVSGQNCGCAPNLCCSQFGYCGTTNDYCGPGCRSGPCTGSSGGNTIASIVTDNFFNGIANQAPAGCAGKGFYTRAAFLQAIQPYPTFGTAANSKQEIAAFFAHVTHETGHLCYTREINQANSYCASSTQWPCAPGQKYFGRGPLQISWNYNYGPAGKAIGFDGLNNPDIVATNPAISFKTALWFWMNNVHSIITSGQGFGATIRAINSIECNGANPAAVTARVNYYTSYCSQLGVDPGPNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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