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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000260`

染色体: Chr08 坐标: 1790717-1796743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G000260`
名称	SmilChr08G000260
描述	uncharacterized SmilChr08G000260
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1790717 - 1796743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999853`
GeneID	`130999853`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999853`
原始查询	`LOC130999853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817909]; symbol=AT2G33435; hit=AT2G33435; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817909]; symbol=AT2G33435; hit=AT2G33435; species=arabidopsis; confidence=medium
拟南芥	`AT2G33435` (AT2G33435) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817909] identity=42.71; qcov=0.695; evalue=2.48e-150; confidence=medium
水稻	`Os03g0138100` - identity=45.27; qcov=0.284; evalue=3.97e-48; confidence=weak
GO	GO:0000243 (commitment complex); GO:0008187 (poly-pyrimidine tract binding); GO:0016607 (nuclear speck); GO:0030628 (pre-mRNA 3'-splice site binding); GO:0071004 (U2-type prespliceosome); GO:0089701 (U2AF complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999853

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`XP_057781508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1791009`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A11,A24,B111,B113,B6,C67
`Chr8:1791071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B71
`Chr8:1791109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:1791120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:1791191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr8:1791274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:1791330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:1791351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C44,C59
`Chr8:1791364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B37,C54,C60,C77
`Chr8:1791366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,D7
`Chr8:1791470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:1791540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C14,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781508.1

996 aa

498

996

RRM_1

PF00076 RRM_1 601-668 aa

XP_057781509.1

994 aa

497

994

RRM_1

PF00076 RRM_1 601-668 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057781508.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	601	668	3e-14	53.4	RNA recognition motif
`XP_057781509.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	601	668	3e-14	53.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925526.1
TGACCAGATATAATTTCGCTCAAACTGTAGTAATTTCTTTTCAAGGTTCTTAATAAAATCGTTTTTTTTTTTTGGACTAATGCTTTGCAACCCTAAATTTAATTACTCGTCTTCCTCTTCTCTTCACTCTTCCACAACAAAGAATCACTCACCGCAAACCACCCCCTTTCTGCGCTCCGCCGTCCTCCGCCGCGACTTCAATTTCTTCTTTCCGTAACCACTGTCAAATATTTGCAGGCGCAGGCCGCGCGGCACTCTTC...

XM_057925525.1
TGACCAGATATAATTTCGCTCAAACTGTAGTAATTTCTTTTCAAGGTTCTTAATAAAATCGTTTTTTTTTTTTGGACTAATGCTTTGCAACCCTAAATTTAATTACTCGTCTTCCTCTTCTCTTCACTCTTCCACAACAAAGAATCACTCACCGCAAACCACCCCCTTTCTGCGCTCCGCCGTCCTCCGCCGCGACTTCAATTTCTTCTTTCCGTAACCACTGTCAAATATTTGCAGGCGCAGGCCGCGCGGCACTCTTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781511.1_40501
ATGGTTAGATCTGATTCACAAAAAGAGATACTCGGAAATACTAATGAAATGCCGCTGGAGGATTTCTTGGATGGCACTTCAGCGAGGACGAGACCGCTGAGTTATGATGACATAATGCTTAGAAGGAAAAACAAGGCAGATGCAGCACAAGTAGTATCCAGCAGCTCTGGAGCAGCTGATAAAGAAGTAGCACAAGACAACGTGGAGAGGGCATCTGATATTCCTGAATGTCATCCGCGGATAAGTGACGATTCAAAACC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781510.1_40502
ATGGTTAGATCTGATTCACAAAAAGAGATACTCGGAAATACTAATGAAATGCCGCTGGAGGATTTCTTGGATGGCACTTCAGCGAGGACGAGACCGCTGAGTTATGATGACATAATGCTTAGAAGGAAAAACAAGGCAGATGCAGCACAAGTAGTATCCAGCAGCTCTGGAGCAGCTGATAAAGAAGTAGCACAAGACAACGTGGAGAGGGCATCTGATATTCCTGAATGTCATCCGCGGATAAGTGACGATTCAAAACC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057781508.1
MVRSDSQKEILGNTNEMPLEDFLDGTSARTRPLSYDDIMLRRKNKADAAQVVSSSSGAADKEVAQDNVERASDIPECHPRISDDSKPLVESTTINDPVKVRSGRKADTNASRKNENSVQDNDDRSLYPDVKSKEKGDRIPRRNRVSEEKFEGRNHASRRKDDLLSVNSDNGLDKRKDSEPYKQDRGLDKRKDGESYKQDRVSERSRVKSEIVKAQPDNKERQVYRKRKTEIDSDSDNEHKKRNVRDARQTDNLTARVREK...

XP_057781509.1
MVRSDSQKEILGNTNEMPLEDFLDGTSARTRPLSYDDIMLRRKNKADAAQVVSSSSGAADKEVAQDNVERASDIPECHPRISDDSKPLVESTTINDPVKVRSGRKADTNASRKNENSVQDNDDRSLYPDVKSKEKGDRIPRRNRVSEEKFEGRNHASRRKDDLLSVNSDNGLDKRKDSEPYKQDRGLDKRKDGESYKQDRVSERSRVKSEIVKAQPDNKERQVYRKRKTEIDSDSDNEHKKRNVRDARQTDNLTARVREK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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