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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000283`

染色体: Chr08 坐标: 1928221-1933299 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000283`
名称	SmilChr08G000283
描述	calreticulin-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1928221 - 1933299 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999869`
GeneID	`130999869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999869`
原始查询	`LOC130999869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calreticulin-3
产物	calreticulin-3
Arabidopsis	`AT1G08450` (CRT3) calreticulin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837365] identity=74.16; qcov=0.983; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os05g0507300` - identity=80.85; qcov=0.794; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006457 (protein folding); GO:0030433 (GO:0030433); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00262 (Calreticulin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999869

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057781534.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057781534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1928531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:1929220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr8:1929422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B100,B135,B53,C10
`Chr8:1929969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:1931037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:1931113`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B107,B128,B130,C83
`Chr8:1931113`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B107,B128,B130,C83
`Chr8:1931142`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B1,B107,B137,B60,B68,B84,D9
`Chr8:1931145`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A23,B1,B107,B124,B128,B130,B137,B60,B68,B84,B96,C28,C39,C83,D9
`Chr8:1931172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:1931234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:1931268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781534.1

413 aa

206

413

Calreticulin

PF00262 Calreticulin 28-264 aa PF00262 Calreticulin 265-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781534.1`	Pfam	`PF00262`	Calreticulin	Family	28	264	7.1e-76	256.2	Calreticulin family
`XP_057781534.1`	Pfam	`PF00262`	Calreticulin	Family	265	338	7.1e-76	256.2	Calreticulin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925551.1
CTGTGAAACACGGTCTACTAACGAGTTGACTTCACTTCAATAATTACATAGTACTAATTGAATTCTCTCTCTCTCACACACACACACATACAAACACACACACTGAGGCATAGAATTGATGAGAGTGTTCTGAATTTCTTCGTTTTGCTGATTAAATATGGAAATTCATCTGAATCAGCTTCTCCTTTTGCTGCTAACTCTCCAATTCGCTGTCGAATTCGCCGTCTCAGAAATAATTTTTGAAGAACGTTTCGAAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781534.1_40532
ATGGAAATTCATCTGAATCAGCTTCTCCTTTTGCTGCTAACTCTCCAATTCGCTGTCGAATTCGCCGTCTCAGAAATAATTTTTGAAGAACGTTTCGAAGATGAGTGGAAGAGTAGGTGGGTGCTGTCTGATTGGAAAAGGAGTGAAGGAAAAGCTGGTACATTCAAACACACAGCTGGGAAATGGAATTCTGATCCAGATGACAGAGGTATCCAAACATATCCGGATGCAAAACACTATGCCATTTCCGCGAAGATACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781534.1
MEIHLNQLLLLLLTLQFAVEFAVSEIIFEERFEDEWKSRWVLSDWKRSEGKAGTFKHTAGKWNSDPDDRGIQTYPDAKHYAISAKIPEFSNKNRTLVLQYSIKFEQDIECGGGYIKLLSGYVNQKKFGGDTPYSLMFGPDLCGPQTKKLHVILSYQGQNYPIKKDLQCETDKLTHFYTFILRPDATYSVLVDNRERESGSMYTDWDILPPPKIKDVHAKKPADWDDREYIDDPDDVKPEGYDSVPAEIPDPKSKKPADWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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