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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000687`

染色体: Chr08 坐标: 5095653-5099640 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000687`
名称	SmilChr08G000687
描述	GTPase LSG1-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5095653 - 5099640 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000261`
GeneID	`131000261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000261`
原始查询	`LOC131000261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTPase LSG1-1-like
产物	GTPase LSG1-1-like
Arabidopsis	`AT1G08410` (AT1G08410) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837361] identity=66.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0618300` - identity=63.4; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782052.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782052.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057782052.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782052.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5097233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B19
`Chr8:5097266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B19
`Chr8:5097938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B90,B92,C8,C87
`Chr8:5098456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:5098478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr8:5098492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:5098564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:5098621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C58
`Chr8:5098627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C24,C57
`Chr8:5098676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B52
`Chr8:5098924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:5098942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B117,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782052.1

589 aa

294

589

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 314-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782052.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	314	383	2.9e-18	66.7	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926069.1
TAACGAAAATAATTGGGCTGGCGTCAGTCGTGACGACTGTTTTTCATTTGGGAAGCGTTTGCAAAGTTTTAGAAGCCCTCCTCCACCTTACCGCCACCACAACCGCCACACCCAGCAGGCCGCGCTGCCGTATATCTACGCCCACCCGCCCTACTTCTTCTCCGCATCTCCACTTTCAATTTACCATCCACAAACTGCAGCGAGAGCCACATAGAGGTGGATTAACATGCCGAAGGGAGAGAAAAGCGTCCTCGGCCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000261
ATGCCGAAGGGAGAGAAAAGCGTCCTCGGCCGCGCTCTTGTGAAGCACCACAATCAGATGATACAGCAGACCAAGGAGAAAGGCAAGTTATACCGAAGCCAGCACAAGAAGGTTCTCGAATCGGTCACGGAGATCAGCGACATCGAAGCCGTCATCGAGCAGGCCGACGAGGCCCACCGCCTTTACTCCTCTCTCAATCCCGGCCAATATCCCATCAATTTGGATTCTGCTTCCAGCACAATTGATATGACACCGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782052.1
MPKGEKSVLGRALVKHHNQMIQQTKEKGKLYRSQHKKVLESVTEISDIEAVIEQADEAHRLYSSLNPGQYPINLDSASSTIDMTPEERREQQKKEEALHASSLRIPRRPPWNAKMSVEELDDNEKRAFLEWRRNLARLEENENLVLTPFEKNLDIWRQLWRVLERSDLIVMVVDARDPLFYRCPDLEAYAREIDEHKSTLLLVNKADLLPFSVRQKWANYFHQHGILFLFWSAKAATAALEGKELSLSVGTAQDLADAET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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