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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000725`

染色体: Chr08 坐标: 5373054-5386038 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G000725`
名称	SmilChr08G000725
描述	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5373054 - 5386038 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000299`
GeneID	`131000299`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131000299`
原始查询	`LOC131000299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
产物	structural maintenance of chromosomes protein 3-like
拟南芥	`AT2G27170` (TTN7) Structural maintenance of chromosomes (SMC) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817259] identity=67.94; qcov=0.999; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os02g0133300` (SMC3) - identity=82.42; qcov=0.213; evalue=4.75e-144; confidence=weak
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005694 (chromosome); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0061775 (cohesin loader activity)
KEGG	-
Pfam	PF02463 (SMC_N); PF06470 (SMC_hinge); PF13304 (AAA_21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000299

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`XP_057782124.1`
2	染色体	1.00000	`XP_057782124.1`
3	核质	0.80000	`XP_057782124.1`
4	着丝粒	0.60000	`XP_057782124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5373468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B134,B31
`Chr8:5373553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:5374048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C48,C72
`Chr8:5374380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C4,C42
`Chr8:5375738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5379103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B105,B37,C6,D9
`Chr8:5381178`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr8:5381178`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr8:5381504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C66
`Chr8:5382720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr8:5384800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:5384827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782124.1

1204 aa

602

1204

SMC_N

SMC_hinge

SMC_N

AAA_21

PF02463 SMC_N 2-133 aa PF06470 SMC_hinge 523-633 aa PF02463 SMC_N 873-1181 aa PF13304 AAA_21 1050-1160 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057782124.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	2	133	1.8e-54	185.2	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057782124.1`	Pfam	`PF06470`	SMC_hinge	Domain	523	633	2.2e-30	106.1	SMC proteins Flexible Hinge Domain
`XP_057782124.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	873	1181	1.8e-54	185.2	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057782124.1`	Pfam	`PF13304`	AAA_21	Domain	1050	1160	8.3e-16	59.5	AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926141.1
CCAACTTAAAGTGAGAAAACGTTGAAAAAGAAAATACAAAATGAAAACATTGTTGGCGTGGAGTCAATTCCCTCCATTTCCATCTTTTCTTCCATCTCTCCTTTTCTCTCCCCTCTCTCTTGCACCTACGCTCACCTCACTGGGTAGACTACACACATAGCTCAACATCACCGCCTTCCACCGCTCACTGGGAGTCGGATTTAATCATTTTGCTTCTTCTCGCTCAATTTGGAGAGCAGTCTCAAACTGCACTGAATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782124.1_41112
ATGTATATAAAGCAGGTTGTAATAGAAGGGTTTAAGAGTTACAGGGAACAGATTTCAACTGAAACATTCAGTCCCAAAGTTAACTGTGTTGTTGGTGCTAATGGATCCGGTAAATCTAACTTCTTCCACGCAATACGCTTTGTGATAAGTGACCTATTCCATAACTTGCGTAATGAAGAAAGGCAAGCATTGCTTCATGAAGGTGCAGGCCACCAGGTGTTATCAGCGTTTGTGGAGATCGTCTTTGATAACTCGGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782124.1
MYIKQVVIEGFKSYREQISTETFSPKVNCVVGANGSGKSNFFHAIRFVISDLFHNLRNEERQALLHEGAGHQVLSAFVEIVFDNSDNRIPVDKEEVRLRRTIGVKKDEYFLDGKHITKTEVMNLLESAGFSRSNPYYVVQQGKIASLTLMKDSERLDLLKEIGGTRVYEERRRESLKIMQETGNKRKQIIQVVQYLDDRLRELDEEKEELKKYQQLDRQRKSLEYTIYDKELHDAKLQLAKIDEDRYRVSEKSATMYNSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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