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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000824`

染色体: Chr08 坐标: 6098902-6101837 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G000824`
名称	SmilChr08G000824
描述	nitrogen regulatory protein P-II homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6098902 - 6101837 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000408`
GeneID	`131000408`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131000408`
原始查询	`LOC131000408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nitrogen regulatory protein P-II homolog
产物	nitrogen regulatory protein P-II homolog
拟南芥	`AT4G01900` (GLB1) nitrogen regulatory P-II-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828213] identity=64.32; qcov=0.956; evalue=2.1e-80; confidence=high
水稻	`Os05g0133100` (OsGlnB) - identity=74.05; qcov=0.636; evalue=1.14e-67; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006808 (regulation of nitrogen utilization); GO:0009534 (chloroplast thylakoid); GO:0030234 (enzyme regulator activity)
KEGG	-
Pfam	PF00543 (P-II)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000408

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	叶绿体	1.00000	`XP_057782276.1`
2	叶绿体基质	1.00000	`XP_057782276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6099167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A10,A19,A3,A4,B102,B104,B105,B107,B11,B114,B118,B119,B134,B14,B21,B27,B31,B32,B38,B4,B40,B46,B63,B65,B66,B67,B74,B79,B97,C16,C28,C31,C35,C37,C41,C66,C67,C68,C72,C82,C85,D11,D2
`Chr8:6100398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C39
`Chr8:6100936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C81,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782276.1

206 aa

103

206

P-II

PF00543 P-II 76-180 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057782276.1`	Pfam	`PF00543`	P-II	Domain	76	180	1.5e-27	96.6	Nitrogen regulatory protein P-II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926293.1
ATTTAAAAGCTTATATTTAAAATCTTATAAGGGGAGCCAAACTCCTCTTTGATTGTTCTGTTGTAACAAAGTGGAAGTTATAACAAAGATCAATTAACCGCAAATCATCAATAATTTGCTTCCCACATCTTTCACCAGCTGCTCTCGAGATCCTCCCATGGCGGCGTCCACCGCGATTGCAAATTCCTCCGCCGCTCTCGCCGCCGTTAACTCTCGCCACCACCTCTGCCCTAAATTTGCCTCCATTTCACTCATCCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782276.1_41254
ATGGCGGCGTCCACCGCGATTGCAAATTCCTCCGCCGCTCTCGCCGCCGTTAACTCTCGCCACCACCTCTGCCCTAAATTTGCCTCCATTTCACTCATCCACGGCCTTCGAGAATTCCGCCCTTCTCCGCTCGGTCTCGCACATCATTGCGCTACAAATGGTTCTTCTCTACCGATTATTAGAGCTCAGAATTCTCCAGCTTACATACCTGAGGCCAATTTCTACAAAGTTGAGGCAATTCTGAGACCGTGGAGGATCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782276.1
MAASTAIANSSAALAAVNSRHHLCPKFASISLIHGLREFRPSPLGLAHHCATNGSSLPIIRAQNSPAYIPEANFYKVEAILRPWRIQQVSSALLKMGIRGITVSDVRGFGAQGGSAERQAGSEFSEDNFVVKVKMEIVVSKDQVEEIIAKIIDEARTGEIGDGKIFVSPVADIIRVRTGERGEKAERMTGGRSDMFSVGSSSTGAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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