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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004223`

染色体: Chr01 坐标: 60594091-60597526 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004223`
名称	SmilChr01G004223
描述	protein trichome birefringence-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60594091 - 60597526 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000552`
GeneID	`131000552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000552`
原始查询	`LOC131000552`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like
产物	protein trichome birefringence-like
Arabidopsis	`AT5G06700` (AT5G06700) trichome birefringence-like protein (DUF828) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830559] identity=58; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0207500` (OsTBL32) - identity=57.3; qcov=0.793; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782518.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782518.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782518.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782518.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60594616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:60594916`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr1:60594916`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B97
`Chr1:60594919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:60595057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:60595084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,D9
`Chr1:60595106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:60595150`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	B103,B109,B118,B12,B124,B140,B15,B21,B23,B27,B34,B37,B40,B55,B57,B58,B63,B69,B72,B9,C12,C13,C23,C24,C29,C39,C45,C51,C6,C60,C61,C64,C77,C78,C79,C8,D2,D4,D8
`Chr1:60595170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,C17,C25,C83
`Chr1:60595297`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	B1,B100,B101,B125,B13,B132,B33,B38,B39,B40,B71,B82,B90,B92,B93,B94,C2,C31,C32,C49,C51,C61,C68,C71,C87
`Chr1:60595326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:60595704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782518.1

599 aa

300

599

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 245-296 aa PF13839 PC-Esterase 298-584 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782518.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	245	296	6.8e-22	78.3	PMR5 N terminal Domain
`XP_057782518.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	298	584	2.1e-102	343.6	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926535.1
ATGTTTTTGGTTTTCCTTTATTTTATAGGTCACATGCATAGTCATATGCGCATATAATTCCACACCGTCGGTCCCTCCCTCTCTTTCTCTCTCACACGCATTGACGCACAGTCCCCACACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGACATTCACACACAACACGAAGAGACAACACTACAACAAGCCAACAACAGTCGTCACAAGCTAAGAACAGTCCTCCCAAGCGAATTCTTTCTCCTCCATTCCTCTCTCTCTCTCACACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000552
ATGGCAGATATAACCAAGTACGCACCCATTAATGGCGGCAACTTGATCTCAGACTTGAAATCTCAATTCTCAATCATCAGAACTAGAAAAACCGTCGGTTTTGCTTATGCCTTCGTCTTCGTCTTCATCGCCTTCACCATCTTCCTTGCTTTTACTCCTTCCTCAACCTCCTCTTCCCCTTGGTTCACTAACATTTTCATTCTTCCCTCCACCACTAATGCAACTTCTCCATCTTCATCTTTAGATCAATCTCATTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782518.1
MADITKYAPINGGNLISDLKSQFSIIRTRKTVGFAYAFVFVFIAFTIFLAFTPSSTSSSPWFTNIFILPSTTNATSPSSSLDQSHFSSIYGYFFPNSSSPDSQNSSLPQNAGSPSPQNHSPPHKVEVLNPTNATNSPEKSDVNRTSSGESEVSKQNQTQIQDKVEVLKPNQTTIPATKSPEPANTTVNSSPESASGSKNISANGEKGIAEKGVTKNLTSSLVKKQSNGTNVEKKGTDDLINSLMNCDFFDGNWVKDESYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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